水稻OsSsr1基因的生物信息学教案分析.docxVIP

水稻OsSsr1基因的生物信息学分析 摘要: OsSsr1 (GeneBank登录号为NM_001065574)是NJH12表达谱中的一个表达量上调基因,为了进一步分析其序列特征、启动子序列、亚细胞定位及在水稻不同组织和各种逆境胁迫下的表达模式,通过生物信息学手段对其进行分析。序列分析表明OsSsr1的开放阅读框为2004 bp,编码一个由667个氨基酸组成并含有5个跨膜区的蛋白,该蛋白N端含有一个信号肽。OsSsr1基因在氷稻不同不同组织中均有表达,在叶部的表达量最高,其次为根,在幼穗中的表达量最低;表达水平受干旱、高温、高盐、低温、机械伤害、稻瘟病菌等的影响。 前言: 水稻是中国也是全世界重要的粮食作物之一，，盐害是水稻生产中最不利的限制因素之一[1-4]。然而水稻在生长发育过程中常常受到干旱,低温和高盐等非生物胁迫，严重影响水稻的产量和品质。因此，分离鉴定水稻耐逆相关基因，培育耐逆品种，对水稻的高产稳产具有重要意义[5]。 当植物遭受非生物胁迫时,植物会发生一系列形态、生理、化学和分子上的变化。干旱、高温和土壤盐渍化是最常见的非生物胁迫。全球农业用地大约22%是盐碱地[6],并且由干旱而造成的盐碱地也在逐年增加[7]。植物在逆境条件下对不同环境因子响应的方式通常会重叠。尽管对麦类植物进行千旱和髙盐处理的基因表达谱显示,在不同的胁迫下响应的基因有所差异,但是它们可