硕士研究生课后基因组学章跃陵基因组测序,序列组装,基因鉴定.研究报告.ppt

Chaper 3 结构基因组学的核心研究技术——基因组测序、序列组装与基因的鉴定 一、 DNA测序的基本方法 1、 链终止法测序(the chain termination method) 2）技术路线与要求 制备单链模板 ↓ 将单链模板与一小段引物退火 ↓ 加入DNA多聚酶 4种脱氧核苷酸 分别加入少量4种双脱氧核苷酸 ↓ 将4种反应产物分别在4条泳道电泳 ↓ 根据4个碱基在4条泳道的终止位置读出基因序列 2 化学降解法测序（Maxam和Gibert于1977年发明） 2）技术路线 将双链DNA样品变为单链 ↓ 每个单链的同一方向末端都用放射性同位素标记,以便显示DNA条带 ↓ 分别用不同方法处理,获得只差一个核苷酸的降解DNA群体 ↓ 电泳,读取DNA的核苷酸顺序 3 自动化测序 1）基本原理 与链终止法测序原理相同,只是用不同的荧光色彩标记ddNTP,如ddATP标记红色荧光, ddTTP标记绿色荧光,ddCTP标记蓝色荧光, ddGTP标记黄色荧光,.由于每种ddNTP带有各自特定的荧光颜色,而简化为由1个泳道同时判读4种碱基. 4 、非常规测序及未来测序方法 2）单分