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DNA和染色体 第一节:DNA结构 第二节:DNA的变性、复性和COt曲线 第三节:原核生物染色体及基因组结构特点 第四节:真核生物染色体及基因组结构特点 核酸的化学组成 基本碱基结构和命名 核苷酸的结构和命名 常见(脱氧)核苷酸的结构和命名 DNA、RNA的一级结构 DNA的二级结构 DNA双螺旋结构的呼吸作用: DNA双螺旋机构中,配对碱基之间的氢键处于连续不断的断裂和再生的动态平衡中。 三、双螺旋结构的基本形式 (P36) 三种DNA双螺旋构象比较 A-DNA双螺旋: RNA-DNA(转录) RNA-RNA RNA的核糖2’-OH的存在,使之不能适应B构象,否则将与相邻的磷酸、核糖和碱基上的若干原子靠的太近而造成不安定状态。 超螺旋(三级结构)和拓扑异构 螺旋和超螺旋电话线 DNA超螺旋结构的形成 DNA超螺旋的形成 超螺旋数(W)改变的结果之一是产生超螺旋 或是在B-DNA中保留一单链区域,但须能量的供给 B-DNA是力学上稳定的结构( 10 bp/ helix) 由上看出,超螺旋概念的要点: 初级螺旋处于松缠或紧缠状态; 与松弛形式相比具有额外的自由能。 DNA超螺旋结构形成的意义 原核生物两类拓扑异构酶 拓扑异构酶的反应本质:先切断DNA的磷酸二酯键,改变DNA的连接数(L)后再连接之,兼具DNA内切酶和DNA连接酶的功能,但不能连接事先已经存在的断裂DNA。 拓扑异构酶的断裂反应和连接反应是相偶联的。 DNA的变性、复性与Cot曲线 原核生物染色体及基因组 原核生物DNA特点(P22): 一般只有一条染色体,且大都带有单拷贝基因,只有少数基因(如rRNA)以多拷贝形式存在; 整个染色体DNA几乎全部由功能基因和调控序列组成; 几乎每个基因序列都与它编码的蛋白质序列呈线性对应状态。 原核生物基因组特点(P31) 结构简练 存在转录单元(多顺反子) 存在重叠基因 1957年,美国分子生物学家西莫尔·本泽尔(seymour Benzer,1921--)以T4噬菌体为材料,在DNA分子水平上研究基因内部的精细结构,提出了顺反子(cistron)的概念。顺反子也就是基因的同义词。 在原核细胞中,通常是几种不同的mRNA连在一起,相互之间由一段短的不编码蛋白质的间隔序列所隔开,这种mRNA叫做多顺反子mRNA。这样的一条mRNA链含有指导合成几种蛋白质的信息。 真核生物染色体及基因组 组蛋白的特点(P24): 进化上的极端保守性 无组织特异性 肽链上AA分布的不对称性 组蛋白的修饰作用 富含Lys的组蛋白H5 染色体上非组蛋白类型: HMG蛋白 DNA结合蛋白 A24非组蛋白 真核生物染色体DNA组装不同层次的结构 重复序列(P27)1、高度重复序列 名词: 染色体 核小体 基因家族 断裂基因 问答: 比较原核生物基因组和真核生物基因组 DNA链形成的核小体串 从DNA到染色体的过程(P28) Compaction ratio = 8000 DNA (2nm) 核小体链( 11nm,每个核小体200bp) 纤丝( 30nm,每圈6个核小体) 突环( 150nm,每个突环大约75000bp) 玫瑰花结( 300nm ,6个突环) 螺旋圈( 700nm,每圈30个玫瑰花) 染色体( 1400nm, 每个染色体含10个玫瑰花200bp) 6.8:1 40:1 1000:1 8000:1 DNA double helix Nucleosome (10 nm fiber) 30 nm Fiber Loops I Loops II chromosome 卫星DNA(Satellite DNA): 将DNA切成数百个碱基对的片段进行超速离心时,由于富含AT的简单高度重复序列区段浮力密度较小,因而很容易和总体DNA分开,即常会在主要DNA带的上面有一个次要的带相伴随 a、分布于着丝点, 端粒区(原位杂交), 结构基因两侧 (根据重复频率和大小又可分为卫星、小卫星和微卫星DNA) b、往往没有功能,不转录(着丝粒 纺锤体) 人类和其他动物中:短的串联重复 5-50 copies / genome 而且有共同的核心序列,但同一群体中重复次数变动很 大,个体间长度变化很大,可利用其得到DNA指纹图 (DNA finger printing) ☆ 数目可变的串联重复或小卫星 ( Variable number tandem repeats . VNTR ) 限制性酶切某一个体DNA 电泳 用制得的小
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