2.、DNA复制.ppt

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参与真核细胞DNA复制的主要蛋白质和酶的结构与功能(续) 蛋白质名称 大小(kDa) 功能 复制因子C (RFC) 140, 40, 38, 37, 36 装载PCNA到DNA,依赖于DNA的 ATP酶活性(受到PCNA的刺激),与引物的3′-端结合,结合需要 ATP。参与聚合酶的切换:打破RPA和DNA聚合酶α/引发酶的接触,从而使聚合酶δ与 PCNA相连。 分裂细胞核抗原(PCNA) 36 提高聚合酶δ和聚合酶ε进行性,形成三聚体的环形结构(类似于大肠杆菌DNA 聚合酶III的β亚基),也可以和 RFC、FEN-1、核苷酸切除修复蛋白XPG以及其它一些蛋白质结合。 拓扑异构酶I 110 释放复制叉前面的超螺旋张力。 拓扑异构酶 IIa或IIb 170 (IIa), 180 (IIb) 分开连环体。 翼式内切核酸酶(FEN-1) 43 5′→3′外切酶/内切酶,切除冈崎片段5′-端的RNA引物,但不能水解与单链DNA相杂交的5′-三磷酸核苷酸(需要RNaseH1切掉5′-端的一段核苷酸),与PCNA的结合可刺激它的活性到10倍。FEN-1还能去除由DNA聚合酶α/引发酶合成的错配核苷酸。 RNaseH1 89 内切核酸酶,切断引物在5′-端留下单核糖核苷酸。 DNA连接酶I 125 连接冈崎片段,结合PCNA。使用ATP为能源。 SV40的 DNA复制模型 线形DNA末端复制问题的解决 (1)使用端聚酶; (2)将线形DNA暂时转变为环形DNA; (3)经重组形成串联体; (4)滚环复制; (5)使用蛋白质-dNTP作为引物。 T7噬菌体DNA末端DNA的复制 DNA复制的高度忠实性 (1)四种dNTPs浓度的平衡 (2)DNA聚合酶的高度选择性 (3)DNA聚合酶的自我校对 (4)错配修复 (5)使用RNA作为引物(?) 因为DNA合成刚开始的时候难以与模板链形成稳定的双螺旋,容易发生错配,用RNA做引物则可以降解之~~ 绝 句 南京大学 生化系 杨荣武 复错不要紧, 只要校对真, 错了我一个, 还有后来酶。 干细胞分裂过程中的“不朽链假说” 干细胞的分裂是不对称的,而分裂的不对称性使以后的干细胞能够选择性得到含有最老的DNA模板的染色体。这样的假设是合乎逻辑的,因为如果一个干细胞在分裂中抓住最老的DNA,就等于将复制可能产生的错误“拒之门外”,从而大大降低了细胞癌变的可能性,而将来分化成体细胞的子细胞得到易错的新DNA也没有什么危险,因为它们很快停止分裂或者死亡,特别是在高度更新的组织。 “不朽链假说”图解 DNA复制的调节机制 DNA复制的调控主要集中在起始阶段, 原核细胞DNA复制起始的调控 在大肠杆菌,由Dam甲基化酶和DnaA蛋白控制。 真核细胞DNA复制起始的调控 (1)由执照因子控制的正调控 (2)由增殖蛋白控制的负调控 甲基化对原核细胞DNA复制的调节 酵母细胞DNA复制的正调控 * 9 * 9 * 9 * 7 * 9 * 9 DNA拓扑异构酶的催化的转酯反应 II型DNA拓扑异构酶的作用机制 5. DNA引发酶 是一种专门用来起动或引发DNA合成的酶。由于DNA聚合酶本身不能起动多聚物的合成,只能延伸已经被起动的多聚物,因此,引发酶是DNA复制所必需的。因为DNA复制的半不连续性,所以, 引发酶在前导链上只需用引发一次,而在后随链上则需用引发多次。 大肠杆菌引发酶的结构模型 6. 切除引物的酶 RNA引物只是用来起动DNA的复制,它最终并不存在于被复制的DNA分子之中,迟早要被除去,实际上,细胞内有专门的酶负责切除RNA引物。原核细胞内切除RNA的酶是DNA聚合酶I或核糖核酸酶H。真核细胞负责切除RNA引物的酶是RNase HⅠ/FEN1或FEN1/Dna2。 7. DNA连接酶 是一类催化一个双螺旋DNA内相邻核苷酸3′-羟基和5′-磷酸甚至两个双螺旋DNA两端的3′-羟基和5′-磷酸发生连接反应形成3′,5′-磷酸二酯键的酶。 DNA连接酶在DNA复制过程中的作用是“缝合”后随链上相邻的冈崎片段,使不连续合成的后随链成为一条连续的链。 DNA连接酶在催化连接反应时需消耗能量。根据能量供体的性质,连接酶可以分为两类:第一类使用 NAD+,第二类使用ATP。细菌的DNA连接酶属于第一类,真核细胞、病毒和噬菌体的连接酶属于第二类。 DNA连接酶的作用机理 8. 尿嘧啶-DNA糖苷酶 尿嘧啶-DNA糖苷酶是一种专门用来切除出现在DNA链上非正常尿嘧啶碱基的水解酶。 尿嘧啶出现在DNA链上有两种原因: 一是在DNA复制过程中,细胞中存在的dUTP代替dTTP直接进入新合成的DNA链; 二是DNA分子中的胞嘧啶碱基发生自发脱氨基作用。 9. 端聚

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