基因与基因组解说.ppt

* * * * * 腺病毒 (adenovirus) 线性双链DNA，编码两大类蛋白质。 E4 E2B E2A E1A E1B E3 L2 L3 L4 L5 L1 6.功能相关基因转录成多顺反子； DNA * 人乳头瘤病毒(human papillomavirus) 7.病毒基因组大部分为编码序列； 环状双链DNA 衣壳蛋白 DNA复制 膜信号蛋白 组装与释放 中断细胞生长周期 上游调节区(URR) * 噬菌体ΦX174（phage phix 174 ） 利用有限的核酸贮存更多的遗传信息，提高自身在进化过程中的适应能力。 5386nt 编码2500个氨基酸 5386nt 编码2500个氨基酸 环状单链DNA 8. 基因重叠（gene overlap） dsDNA 乙型肝炎病毒（Hepatitis B virus, HBV） HBcAg 聚合酶 HBsAg 3182bp 3182bp HBsAg 聚合酶 HBcAg HBeAg dsDNA 翻译 蛋白质 mRNA 转录 -ssDNA 反转录 +ssDNA 复制 病毒 颗粒 dsDNA cccDNA 修复 * 开环部分双链DNA 基因重叠（gene overlap） * 人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus, HIV） 单链RNA 逆转录酶 核心蛋白 膜蛋白 （二倍体） 9. 除逆转录病毒(retrovirus)为二倍体外，  其它病毒通常为单倍体基因组。 +ssRNA 翻译 蛋白质 病毒 颗粒 mRNA 转录 ssDNA 反转录 (+ssRNA) dsDNA 整合 * 病毒基因组的结构特点 2. 除逆转录病毒外，为单倍体基因组； 1. 不同病毒基因组可以是不同结构的核酸； 3. 病毒基因组有的是连续的，有的分节段； 4. 有的基因有内含子； 5. 病毒基因组大部分为编码序列； 7. 功能相关基因转录为多顺反子。 6. 有基因重叠现象； * 三、真核生物基因组 人类染色体核型 C值＞3000 Mb, 基因数＞20,000 人类线粒体DNA (一)真核生物基因组结构特点 1.每一种真核生物都有一定的染色体数目；2.远大于原核基因组，结构复杂,基因数庞大； * Translation Transcription mRNA DNA Protein Promoter Structure Gene 3′ 5′ 3.真核基因有内含子; 单顺反子(monocistron)：真核生物的一个结构基因转录生成一个mRNA分子。 4.真核生物的结构基因转录为单顺反子； * 编码序列 非编码序列 单拷贝序列 5.非编码序列多于编码序列； ＜3％ ＞95％ 高度重复序列（≥106） 低度重复序列（2～9） 中度重复序列（10～105） 6.存在大量重复序列; * 低度重复序列(Low copy number repeat) 在单倍体基因组中只出现一次或数次，含量＞50％ ，结构基因主要是单一序列。 (1)单拷贝序列（unique sequence DNA ） (2)中度重复序列(Moderately repeated DNA) 重复次数10～105。tRNA、rRNA、组蛋白、免疫球蛋白基因，可能与基因调控相关序列等。 (3)高度重复序列(highly repeated DNA) 重复次数＞106。 ①反向重复序列 ②卫星DNA（串联重复序列） * ①反向重复序列: 5′AAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTT 3′3′TTTGGTGGCGACCATCGCCACCAAA 5′ 5′AAACCACCGCTAGCGGTGGTTT 3′3′TTTGGTGGCGATCGCCACCAAA 5′ 回文结构 两个顺序相同的拷贝在DNA链上呈反向排列。 游上酒楼高对月 月对高楼酒上游 秋中赏月对高楼 楼高对月赏中秋 * ②卫星DNA（satellite DNA） 存在于非编码区的串联重复序列，有相同的核心序列,多为2～70 bp。 * a.大卫星（macro-satellite）DNA： ACAAACT ACAAACT ACAAACT… 重复单位5-10bp，在群体中多态性不显著。 b.小卫星（minisatellite） DNA： 重复单位9-24bp，呈高度多态性。核心序列 GGGCAGGAXG c.微卫星DNA (micro-satellite DNA) 重复单位2-6bp，常见为(AC)n和(TG)n， 呈高度多态性，可作遗传标记。 * Mother Child Father Alleged