分子生态学新.pptVIP

分子生态学 Molecular Ecology Contents 一、定义及研究内容 1.分子生态学形成的背景 分子生态学是分子生物技术发展的产物，经过上世纪60年代同工酶分析时代，到70-80年代遗传变异分析时代，再到90年代的PCR时代， [1]之后，随着新世纪生态环境问题不断复杂化，同时在生态学研究中,人们越来越注重对问题的本质和机制的理解。[2]生态学家和分子生物学家渐渐联合起来，而分子生态学作为两者之间的桥梁，应运而生。 一、定义及研究内容 2.分子生态学的诞生标志 1992年，英国生态学学会主办的《分子生态学》杂志正式创刊。 一、定义及研究内容 3.分子生态学的定义 因为分子生态学是一门新兴的高度交叉的学科，所以很难与其它学科有一个严格的界限。一直一来都是仁者见仁，智者见智。 国际上相对一致的定义是： 分子生态学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境系统相互作用的机理及其分子机制的科学。 一、定义及研究内容 特点：强调生态学研究中宏观与微观的紧密结合, 优势在于对生态现象的研究不仅注意外界的作用条件, 而且注意分析内部的作用机制。[3] 具体来说，分子生态学研究的是怎样利用DNA (基因)、蛋白质(酶)等生物活性分子的活动变化规律的研究资料来阐释生态变化的生物分子活动的规律。[2] [3]黄勇平, 朱湘雄. 分子生态学——生命科学领域的新学科[ J]. 中国科学院院刊, 2003, ( 2): 84- 88. [2] 龙应霞，刘洋. 分子生态学研究概况[J]黔南民族师范学院学报，2006，（3）30-34 一、定义及研究内容 4.分子生态学的研究内容 分子生态学的研究内容可分为两个部分[4]： 1.基于DNA水平的研究 主要研究对象是mtDNA、叶绿体DNA、核糖体DNA 及基因组DNA (或染色体DNA ); 主要研究方法有限制性片段长度多态法( RFLP)、扩增片段长度多态法( AFLP)、PCR法、随机扩增多态DNA 法( RAPD)、DNA 序列分析法、DNA 指纹图谱法、DNA 杂交技术等。 [4]李景文, 李俊清, 张华容. 生态学研究热点—— 植物分子生态学[ J]. 植物杂志, 2001( 4) : 40- 41. 一、定义及研究内容 RFLP较常用，以此为例 原理： 利用限制性内切酶位点专一性的特点, 将DNA 酶切消化后产生许多长短不一的片段, 这些片段的数目与长度反映了DNA 上限制性位点的分布, 对某一特定DNA 序列/限制性内切酶组合, 所产生的片段也是特定的, 它能作为该DNA 或含有该DNA 生物的指纹。不同DNA 样本经相同限制性切酶完全消化后产生的片段数目和大小上差异就构成了限制性片段长度多态性。[2] [2] 龙应霞，刘洋. 分子生态学研究概况[J]黔南民族师范学院学报，2006，（3）30-34 一、定义及研究内容 2.基于蛋白质水平的研究 内容多采用多位点等位酶为指标。 主要方法是蛋白质免疫法和蛋白质电泳法,其中蛋白质电泳法最为常用。 蛋白质电泳法原理：因为蛋白质的多样性归根结底还是取决于基因的多样性，我们通过蛋白质电泳所获得的多位点等位酶资料, 可以用来分析基因的变异情况,由此可以得出如遗传多样性和遗传分化等一些有价值的结论。[5] [5]黄瑞林, 印遇龙, 侯振华等. 分子生态学的兴起与应用[ J]. 广西农业生物科学, 2005, 24( 1): 80- 85 二、应用及相关实例 二、应用及相关实例 实例一： 微生物分子生态学是通过分析样品中DNA 分子的种类、数量和多态性等基因组信息来反映环境微生物的种类、种群数量和群落变化等信息的分支学科。 建立高效、可靠的微生物总DNA 提取方法是进行微生物分子生态学研究的基础, 而DNA 的纯化是获取高纯度微生物总DNA 的关键步骤，根据张于光[6]等的研究，变性剂加SDS 高盐法是一种更为高效、可靠且适合于环境微生物分子生态学研究的DNA 提取方法. [6]张于光，李迪强，王慧敏，肖启明.用于分子生态学研究的土壤微生物DNA提取方法[J]应用生态学,2005,16(5):956-960 二、应用及相关实例 实例二： 环境中微生物的群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理一向是微生物生态学的研究热点。 但是，现代分子生物学证实传统的纯培养方法培养的菌种很有限，大多数的微生物不能用这种传统方法培养，(e.g.