植物细胞核基因组材料.pptVIP

* 第一章 植物细胞核基因组 Genome (基因组): all DNA sequences in a cell Gene (基因): a stretch of continuous DNA sequence encoding a protein or RNA 核基因组: 局限在核内的基因组 基因组计划：指的是以整个基因组为对象的研究。例如，水稻基因组计划的研究对象，就是总长为4.3亿个核苷酸的全部12条染色体。由于研究对象涉及生命体的全部遗传信息，因此也有人称这类研究为全生物学研究(complete biology)。此项研究的工作量特别庞大，体系极其复杂，并涉及多种学科，如分子生物学、遗传学、计算机科学等。长期以来，人们就知道基因组计划的重要性，但这类研究1990年初才真正开始，那就是美国的人类基因组计划。因为相关的科学技术到这一阶段才开始在总体上成熟，使科学家能够着手进行基因组计划。 基因组计划基本上可分为三项内容： 构建基因组的遗传图； 构建基因组的物理图； 测定基因组的DNA全序列。 这三者之间都有一定的关联，各自研究的进程和结果，又都可促进相关应用科学的发展。? 定义：某一物种的染色体图谱（也就是我们所知的连锁图谱），显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置，而不是在每条染色体上特殊的物理位置。  　　如果同一条染色体上的两个基因相对距离越长，那么他们减数分裂发生重组的概率将越大，共同遗传的概率也就越小。因此可以根据他们后代性状的分离可以判断他们的交换率，也就可以判断他们在遗传图谱上的相对距离。 　　遗传图谱可以对很多的遗传病进行分析. 遗传图谱： 物理图谱是利用限制性内切酶将染色体切成片段，再根据重叠序列确定片段间连接顺序，以及遗传标志之间物理距离［碱基对(bp)　或千碱基(kb)或兆碱基(Mb)］的图谱。 物理图谱： 十余种模式生物(如大肠杆菌、酿酒酵母、线虫、果蝇、拟南芥、小立宛藓等)和水稻、人类的全基因序列测定工作已基本完成。 基因组学（genomics）、结构基因组学（structural genomics）、功能基因组学（functional genomics）、蛋白质组（proteome）和蛋白质组学（proteomics） 结构基因组学（structural genomics） ：是一门研究生物中所有的蛋白质结构。主要利用实验方式(X-射线晶体衍射、核磁共振质谱)或计算方式(Homology Modeling)。和传统结构生物学不同的是，利用结构基因组学方法测定蛋白质结构时通常知道蛋白质的功用。这令科学家创立了结构生物资讯学—利用三维结构来估计蛋白质功用。结构基因组学重视快速、大量(high throughput) 的蛋白质结构测定。 结构基因组学(structural genomics)是基因组学的一个重要组成部分和研究领域,它是一门通过基因作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定位的科学。染色体不能直接用来测序,必须将基因组这一巨大的研究对象进行分解,使之成为较易操作的小的结构区域,这个过程就是基因作图;根据使用的标志和手段不同,作图有4种类型,即构建生物体基因组高分辨率的遗传图、物理图谱、序列图以及转录图谱。 功能基因组学（functional genomics)：以基因功能鉴定为目标，又被称为后基因组（postgenome）研究。 研究内容包括基因功能发现、基因表达分析及突变检测。基因的功能包括：生物学功能，如作为蛋白质激酶对特异蛋白质进行磷酸化修饰；细胞学功能，如参与细胞间和细胞内信号传递途径；发育上功能，如参与形态建成等。采用的手段包括经典的减法杂交，差示筛选，cDNA代表差异分析以及mRNA差异显示等，但这些技术不能对基因进行全面系统的分析，新的技术应运而生，包括基因表达的系统分析（serial analysis of gene expression,SAGE），cDNA微阵列（cDNA microarray），DNA 芯片（DNA chip）和序列标志片段显示（sequence tagged fragments display，20th ICG德国柏林）技术、微流控芯片实验室等。 蛋白质组学（Proteomics）一词，源于蛋白质（protein）与 基因组学（genomics）两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。 一、植物核基因组大小 1.核基因组大小的差异 研究方法： 孚尔根染色显微光密度测定法 DNA复性动力学 核体积测定 流式细胞计量术 不同植物的核基因组大小差异可达上千倍之多。已知的最小植物基因组是拟南芥基