真核调控预案.pptVIP

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转录起始复合物的形成 转录因子(transcription factor,TF); 启动子与TF结合后,才能被RNA 聚合酶识别与结合; -25~-30区:TATA盒 影响基因表达活性的DNA序列 非编码序列 包括:启动子、增强子、沉默子等 核心启动子:保证RNA聚合酶II 转录起始所必需的最少的DNA序列,包括转录起始位点及其上游TATA box,产生基础水平的转录 上游启动子元件:包括CAAT box和GC box,提高转录效率 促进转录,不具有启动子专一性 功能与方向,位置无关 远距离发挥作用 (100~500bp,10Kb) 组织或细胞特异性 必须有两个(以上)增强子成份紧密相连 感染真核细胞的病毒DNA大多具有增强子,可被寄主细胞蛋白质激活。 小鼠乳腺瘤病毒(MMTV):具有糖皮质激素基因的增强子,能在被类固醇激活的细胞(如乳腺上皮细胞)中旺盛生长。 1) HTH, Helix-turn-helix 2个?螺旋被一个?转角隔开 识别螺旋,与DNA在大沟中特异结合 λ阻遏蛋白 CRP 酵母接合型调控蛋白α1,α2 C2H2型锌指由两条β链和一条α链组成,后者与DNA大沟结合,该α螺旋区域上含有保守的碱性氨基酸,负责与DNA的结合。 SP1 TF IIIA 344aa,N端与DNA结合 9个锌指,每个~30aa 与5s rRNA基因内启动子(50bp)结合 另一种C4锌指结构是把单体的α螺旋插入到DNA 的连续大沟中,与HLH蛋白类似。 Cys- X2- Cys-X13 - Cys- X2- Cys Zn++与4个Cys结合 DNA结合序列较短,对称 无大量重复性锌指 例如GAL4,酵母的转录因子 哺乳类的固醇类激素受体 包含一个碱性的DNA结合域,其N端与亮氨酸拉链相连,每个α螺旋相连的碱性结构域形成一个对称的结构,沿DNA相反的方向延伸并与对称的DNA 识别位点发生作用,最终像一个夹子夹在DNA上。 40~50aa 含2个?-helix(15~16aa), 由非螺旋的多肽环(12~28aa)连接;两亲性;通过疏水面作用形成二聚体 -NH2端为碱性区,16aa 缺乏碱性区的蛋白质,即使形成(同、异)二聚体,也无法同DNA结合 zyj278 最早在果蝇中发现同形异位现象(homeosis): 果蝇头部长触角部位长出脚来 同形异位盒基因(homeobox) :高度保守的一段核苷酸序列(180bp),控制胚胎发育的基因 从酵母到人类都存在 有3个?—helix H1与H2形成HTH motif H3位于大沟中,与DNA特异结合 N末端位于小沟中,与DNA接触 酸性α-螺旋结构域 如GCN4,GAL4 富含谷氨酰胺结构域 如SP1, AP2, oct1, oct2 富含脯氨酸结构域 如CTF/NF1 不规则的,含双性?-helix 反式作用因子的作用方式 成环、扭曲、滑动等 反式作用因子的组合式调控作用(combinatorial gene regulation) 使有限的反式作用因子可以调控不同基因的表达 真核生物的转录因子,虽然具有较高程度的独立性,仍然可能与原核生物的σ因子起着相同作用,即核心酶识别特异序列,并与之结合。所以没有大量转录因子,RNA 聚合酶II本身不可能识别真核中数量巨大的启动子。 含有短的共有序列; 在不同基因中,拷贝相似,有时有多个拷贝; 与转录起点距离不固定,一般位于上游元件或增强子内;常是启动子的上游元件或增强子 HSP(heat shock protein) 氨基酸序列高度保守 蛋白质功能高度保守 是一种分子伴侣chaperone hsp基因 核苷酸序列高度保守,如人与E.Coli 40~60% 多基因家族,多拷贝,成簇存在 大部分无内含子,如hsp70,转录后不须剪切即可直接产生成熟mRNA,适应需要 HSF, heat shock factor, HSE 结合蛋白,热激转录因子 DNA结合区:3个螺旋,形成疏水区 多聚化区:4个Leu拉链,三聚体有活性 C末端(452~488)保守区 热休克应答的调控机制 常温下,HSF为单体,不与DNA结合(无活性) 真核生物基因的表达调控 2、转录激活结构域(transcriptional activation domain) 3、反式作用因子与顺式作用元件的结合 constitutive expression inducible expression 4、反式作用因子的种类 TF(I,II,III): 通用转录因子 (基础因子):RNA聚合酶结合启动子所必需的蛋白因子 转录调控因子(上游因子):识别并结合在上游元件UPE上,提高转录效率,活性

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