第一章酶学与酶工程(~节)介绍.ppt

Enzyme Engineering酶工程 第一章 酶学与酶工程 第一节 酶工程概述 第二节 酶的分类、组成、结构特点和作用机制 第三节 酶作为催化剂的显著特点 第四节 酶促反应动力学 第五节 酶的抑制作用 第二节 酶的分类、组成、结构特点和作用机制 一．酶的分类： 二．酶的组成和结构特点 三．酶的作用机制 （一）习惯命名法 1961年以前使用的酶的名称都是习惯沿用 的，称为习惯名。主要依据以下原则： 1. 根据酶作用的底物命名，如纤维素酶。 2. 根据酶催化反应的性质及类型命名，如溶菌酶。 3. 根据酶的来源命名，如胰蛋白酶。 有的酶结合上述原则来命名。习惯命名比较简单，应用历史较长，尽管缺乏系统性，但现在还被人们使用。 （二）国际系统命名法 国际系统命名法原则是以酶的整体反应为基 础的，规定每种酶的名称应当明确标明酶的底物 及催化反应的性质。如果一种酶催化两个底物起 反应，应在它们系统名称中包括两个底物的名 称，并以“：”号将它们隔开。若底物之一是水 时，可将水略去不写。 ATP＋D-葡萄糖 ADP＋D-葡萄糖-6-磷酸 国际系统命名为： ATP：D-葡萄糖磷酸转移酶 （三）国际系统分类法及酶的编号 国际酶学委员会，根据各种酶所催化反应的类型， 把酶分为6大类，即氧化还原酶类、转移酶类、水解 酶类、裂合酶类、异构酶类和连接酶类。分别用1、2、 3、4、5、6来表示。再根据底物中被作用的基团或 键的特点将每一大类分为若干个亚类，每一个亚类又 按顺序编成1、2、3、4……等数字。每一个亚类可 再分为亚亚类，仍用1、2、3、4……编号。每一个 酶的分类编号由4个数字组成，数字间由“·”隔开，编 号之前冠以EC（Enzyme Commision)。 1．氧化还原酶 2．转移酶 3．水解酶 4．裂合酶 5．异构酶 6．连接酶（合成酶） 7．核酸酶（催化核酸） 1．氧化还原酶 (Oxidoreductase) 包括脱氢酶(Dehydrogenase) 、氧化酶(Oxidase) 、过氧化物酶、氧合酶、细胞色素氧化酶等 2．转移酶(Transferase) 包括酮醛基转移酶、酰基转移酶、糖苷基转移酶、含氮基转移酶等 3．水解酶(Hydrolase) 脂肪酶、糖苷酶、肽酶等，水解酶一般不需辅酶 4．裂合酶(Lyase) 这类酶可脱去底物上某一基团留下双键，或可相反地在双键处加入某一基团。 5．异构酶(Isomerase) 此类酶为生物代谢需要对某些物质进行分子异构化，分别进行外消旋、差向异构、顺反异构等 6．连接酶（合成酶）(Ligase or Synthetase) 这类酶关系很多生命物质的合成，其特点是需要三磷酸腺苷等高能磷酸酯作为结合能源，有的还需金属离子辅助因子。分别形成C-O键（与蛋白质合成有关）、C-S键（与脂肪酸合成有关）、C-C键和磷酸酯键。 7.核酸酶（催化核酸） Ribozyme 核酸酶是唯一的非蛋白酶。它是一类特殊的RNA，能够催化RNA分子中的磷酸酯键的水解及其逆反应。 酶用于生物催化的概况 三．酶的作用机制 1． 酶的作用过程 2． 酶与底物的结合模型 3 ．酶的催化作用 1． 酶的作用过程 酶的活性部位： 是它结合底物和将底物转化为产物的区域，通常是整个酶分子相当小的部分，它是由在线性多肽中可能相隔很远的氨基酸残基形成的三维实体。 2． 酶与底物的结合模型 a． 锁和钥匙模型 b ．诱导锲合模型 a． 锁和钥匙模型 认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的，酶表面具有特定的形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对一把锁一样 b ．诱导锲合模型 该学说认为酶表面并没有一种与底物互补的固定形状，而只是由于底物的诱导才形成了互补形状. 3 ．酶的催化作用 （1） 研究方法 （2）影响酶的催化作用 （1） 研究方法 a.从非酶系统模式获得催化作用规律 b.从酶的结构与功能研究中得到催化作用机理的证据。 （2）影响酶的催化作用 a. 广义的酸碱催化 b. 共价催化 c. 邻近效应及定向效应 d. 变形或张力 e. 酶的活性中心为疏水区域 a. 广义的酸碱催化 能供给质子的物质即为酸，能接受质子的物质即为碱 例 HA=A-+H+ HA为酸，A-为碱 例 HA（酸）+X=AXH（酸催化） AXH+B-（碱）=Y+BH+A-（碱催化） b. 共价催化 底物与酶以共价方式形成中间物。这种中间物可以很快转变为活化能大为降低的转变态，从而提高催化反应速度 b. 共价催化 亲电试剂：一种试剂具有强烈亲和电子的原子中心。 亲核试剂：就是一种试剂具有强烈供给电子的原子中心。 c. 邻近效应及定向效应 所谓邻近效应就