3 基因组作图分析.pptVIP

遗传标记 是DNA水平上绘制现代遗传图谱的主要路标（landmark)。 采用遗传分析的方法将基因或其它DNA序列标定在染色体上，得到的线性排列图称为遗传连锁图，简称遗传图。 果蝇连锁图 Shotgun测序(1) 二、 物理图谱（physical map） 1.2 部分酶切法测定DNA片段位置 局限性： 随着DNA长度的增加和酶切位点的增多，单酶切、双酶切及部分酶切产生的条带数成比例扩大，需要对大量的片段进行比对和组装。虽可借助计算机，但是难免会产生一些大小非常接近的片段，导致电泳分辨困难。 限制性作图只能应用于较小的DNA分子，上限约50kb 染色体→酵母人工染色体（YAC）重叠群→ 筛选阳性YAC酶切→ cosmid人工染色体重叠群→阳性cosmid酶切→质粒亚克隆→限制酶作图 →计算机分析串联，获得大片段。 二、 物理图谱（physical map） 1.3 基因组限制性酶切作图的技术路线 即：基于克隆的基因组作图 YAC重叠群1000kb cosmid重叠群40kb 限制酶作图、测序分析 质粒亚 克隆 二、 物理图谱（physical map） ＋ 5 3 2 8 5 2 1.3 基因组限制性酶切作图的技术路线 YAC载体是利用酿酒酵母的染色体的复制元件构建的载体。 YAC载体必须含有以下元件：①端粒重复序列（TEL） ②着丝粒（CEN）