第3章生态学家的分子生物学课程资料.pptVIP

目录 3.1生命与核酸的共同起源 分子生物学在其迅速发展中深刻地认识到基因与环境之间的相互作用是产生基因突变和基因多态的源泉。因此，分子生物学对分子生态学最本质的贡献是阐明了外界环境对以中心法则为基础的基因突变、基因表达和蛋白质活性的深刻影响。 生命起源 中心法则 DNA的结构基因组学 RNA的结构基因组学 DNA和RNA的结构基因组学 蛋白质组信息学 蛋白质组学的应用和前景 蛋白质分离技术 分子生态领域的科学技术 分子生态学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境系统相互作用的机理及其分子机制的科学。其特点是强调生态学研究中宏观与微观的紧密结合，优势在于对生态现象的研究不仅注意外界的作用条件，而且需要注意分析内部的作用机制。 Block Diagram 分子生态学常用技术的应用 免疫学 免疫学 Diagram 遗传密码概念的形成和发展 基因组信息学 DNA DNA 非编码DNA和编码DNA 影响DNA 编码的因素 基因芯片 基因芯片的分类 基因芯片的特点 基因芯片合成的主要方法 基因芯片工作基本流程 基因芯片技术的应用 基因芯片技术的前景分析 基因芯片的应用发展存在的问题 按其制备方法不同可分为原位合成芯片和合成后交联芯片。 按其应用不同，可分为表达谱芯片、诊断芯片、检测芯片 按其结构不同可分为 DNA 阵列和寡核苷酸芯片 按其基片不同可分为无机片基芯片和有机合成片基芯片 基因芯片的特点 微化性 并行性 多样性 原位合成 原位合成法主要是光引导聚合技术（Light-directed synthesis），它不仅可用于寡聚核苷酸的合成，也可用于合成寡肽分子。 点样合成 此方法在多聚物的设计方面与原位合成相似，合成工作用传统的DNA 或多肽固相合成仪完成. 基因芯片工作基本流程 反应图谱检测和分析 样品制备和生物分子反应 方阵的构建 基因表达分析与基 因调控机理研究 疾病的基因诊断 与药物设计 基因药物的筛选 单核苷酸多态性分析 及基因突变的检测 DNA测序 提高检测的灵敏度和特异性 提高探针的稳定性 需与生物信息学结合发展 研制新的应用芯片 将与其它技术结合使用 高自动化、方法趋于标准化、简单化，成本减低 进一步提高探针阵列的集成度 建立微缩 芯片实验室 * * * * 第3章 生态学家的分子生物学课程 李永峰 教授 张楠 研究生 生命与核酸的共同起源 3.1 DNA和RNA的结构基因组学 3.2 蛋白质组信息学 3.3 分子生态领域的科学技术 3.4 免疫学 3.5 遗传密码基因表达 3.6 基因组信息学 3.7 DNA 3.8 基因芯片 3.9 从发生学的角度看是 生命可以携带遗传信息 从遗传的角度看是生命 能够完成自我复制过程 从新陈代谢的角度看则是生命能够 催化其生命活动中的化学反应 复制RNA 复制RNA 蛋白质 转录 逆转录 调控 翻译 调控 DNA dAMP dGMP dCMP dTMP RNA AMP GMP CMP UMP DNA的结构基因组学 RNA的结构基因组学 结构基因组学发展前景 DNA的结构基因组学研究就是利用已知的基因结构序列，推测蛋白质结构和蛋白质模型，再利用这些模型深究基因组学。这种结构的保守性使我们能够在了解每一个蛋白质结构的基础上，再确定其他蛋白质的结构。 结构基因组学技术的出现则是将生物技术、基因技术的应用前景推到了一个全新的高度。影响着人类经济、技术、生活、思想等方面的发展和进程。 出许多RNA的各端非翻译区可通过核糖体亚基和蛋白质的相互作用来调节基因的表达，还可通过单一的折叠结构来行使生物功能，甚至是利用大分子结构的RNA、蛋白质复合物等核糖体单位的高分辨率结构分析RNA形成的复合物和不同的三维结构。 蛋白质组 (proteome)讲述的是一个细胞或组织表达的所有蛋白质 蛋白质组信息学 而其研究细胞内全部蛋白质的组成及其活动规律的新兴学科则被称之为蛋白质组学 ( Proteomics)。 共享 用于大量生物 信息资源 研究和开发 收集 存储 处理 搜索 利用 蛋白质分离技术 二维凝胶电泳技术 蛋白质组重叠群 多维LC-MS/MS途径 毛细管电泳 图谱分析 生物质谱技术 微量测序技术 分子生态学主要包括 分子种群生物学 分子环境遗传学 分子适应 分子生态学技术 DNA技术 限制性片段长度 多态性 Southern杂交技术 克隆及 DNA测序技术 聚合酶链式反应 (PCR)的技术 蛋白质电泳技术：蛋白质电泳技术主要是指早期等位酶对一些普遍理论所提出的贡献。 生物信息学 基因组学 蛋白组学 临床医学 免疫学 免疫组学 基因组学对肿瘤免疫学发展的影响 基因组学对免疫病理学的影响 基因组学技术在感染免疫学中的作用