微生物沈萍第12章论述.pptVIP

菌株与型的区别： 菌株之间不存在鉴别性特征的差异，命名不同的菌株无需分类学依据； 不同型的细菌之间存在鉴别性特征的差异，命名或鉴定不同的型必需有分类学依据。 e）为微生物生物多样性和微生物生态学研究建立了全新的研究理论和研究方法，特别是不经培养直接对生态环境中的微生物进行研究。 “Taxonomists counts suggest that insects dominate the diversity game, but new analyses reveal that microbes are the real winners.” 不可培养微生物（uncultured microorganisms） 从环境中直接分离并克隆rRNA并分析其序列和在分子进化树上的位置等方法而发现的目前尚不能在人工条件下获得培养的微生物。 参见不可培养的微生物与生物多样性 3）三（界)域生物的主要特征 三界理论虽然是根据16SrRNA序列的比较提出的， 但其他特征的比较研究结果也在一定程度上支持 了三界生物的划分。 具体内容自学！ （参见P332） 随着越来越多的微生物的全基因组序列的测定，人们发现生物在进化中存在着非常广泛的水平基因转移现象，很多科学家都认为不能仅靠对16SrRNA的序列比较来确定生物之间的亲缘关系，还必须借助各种信息对这个进化树进行改进。 Carl Woose的rRNA进化树完美无缺？ 人类基因组中的细菌基因？ 一项新的研究指出，在我们体内的每个细胞中有40个左右的细菌基因，而不是早先报告的113到233个。这个由细菌到人类寄主的所谓的“横向转移(lateral transfer)”给进化生物学带来了极大的问题，它可能意味着直到现在细菌可能一直在为其自身利益操纵着人类的基因组。 2001年5月18日 美国《科学》周刊292卷 第5520期 第二节 细菌分类 分类是认识客观事物的一种基本方法。我们要认识、 研究和利用各种微生物资源也必须对它们进行分类。 分类(classification)：根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定； (根据现有数据建立系统的过程) 分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分： 鉴定 分类、 命名、 （参见P334） 命名(nomenclature)：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称； (分类系统建立过程中的步骤之一) 鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。 (根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程) 主要以细菌为例介绍微生物分类、命名和鉴定的有关知识 一、分类单元及其等级 界 门 纲 目 科 属 种 （参见P334） 根据Carl Woese的 理论，现在还在界 之上使用域(domain) （把全部生物先分为 古生菌域、细菌域和 真核生物域，域下面 再分界。） 常用的细菌分类学术语： 一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。如微生物的 斜面培养物、摇瓶培养物等。 从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；用实验方法(如通过诱变) 所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌 株，以便与原来的菌株相区别。 菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体 2）菌株(strain)： 1）培养物(culture)： Bacillus subtilisASI.398 Bacillus subtilisBF7658 生产蛋白酶 生产α淀粉酶 常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状 差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 例如抗原特征的差异分为不同的血清型；对噬菌体裂解反应的 不同分为不同的噬菌型等 物种，生物分类中基本的分类单元和分类等级。 高等生物中，“生殖隔离”被看作是区分物种的标准 微生物的种：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其 他类群的菌株有很明显的区别。 3）型(form或type)： 4）种（species）： 二、微生物的命名 双名法，由二个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成， 一般用斜体表示 属名在前，一般用拉丁字名词表示，首字母大写 种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写 若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp来表示， 例如 Bacillus sp 二、微生物的命名 由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标