第3章基因组组的结构与功能重点.ppt

第3章基因组组的结构与功能重点

功能基因组学涵盖了“转录组学”、“蛋白质组学”及部分“生物信息学”的内容。 Relational Query Tools Sequence databases Genome What could happen Gene Expression databases Transcriptome + What would happen Protein Expression databases Proteome + What is happening * (3)家族中各基因编码的蛋白质具有高度的 同源性,但基因的核苷酸序列可能不同。 如 src 基因家族: src,abl,fes,fgr,fps,fym,kck,lck,lyn,ros,tkl,yes NH2 COOH 蛋白激酶同源结构域(250个氨基酸残基) 此家族中各基因的DNA序列没有明显的同源性。 (4)家族中各基因编码的蛋白质中具有很小的保守基序(conserved motif)。 如DEAD box基因家族。 DEAD box:Asp- Glu-Ala-Asp 此家族中各基因的DNA序列没有明显的同源性,但所有的表达产物都有解旋酶的功能,都具有同样的保守基序(DEAD盒),DEAD是酶活性的关键结构。 (5)基因超家族 基因超家族(gene supe

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