第5章真菌类染色体作图14解说.ppt

单林娜 制作 第5章 真菌类染色体作图 第5章 真菌类的染色体作图 5.1 两个连锁基因的作图 5.2 三个连锁基因的作图 5.3 红色面包霉染色体着丝粒作图 5.4 线性四分子分析和无序四分子分析结合使用 5.1 两个连锁基因的作图无序四分子分析（unordered tetrad analysis） 酵母Yeast: Saccharomyces cerevisiae 单细胞藻类single celled alga : 衣藻Chlamydomonas reinhardtii， 构巢曲霉 名 词 四分子(tetrad)：在真菌和单细胞藻类中，减数分裂的四个产物（子囊孢子），以特定的方式结合在一起，称为四分子。 线性四分子(linear tetrad)：子囊孢子以线性方式排列的四分子。 无序四分子(unordered tetrad)：子囊孢子无序排列的四分子。 八分子(actad)：减数分裂的四个产物又经一次有丝分裂所生成的八个产物。八分子是双倍的四分子，对它的分析与对四分子的分析是一样的。 无序四分子三种可能的类型 a b × a＋b＋ 对于连锁的两个基因座a和b，它们之间可能存在以下三种情况（图）： a、b 间无交换 (no crossovers, NCO)。 一次单交换 (a single crossover, SCO)。 存在双交换 (double crossover, DCO)。 当然，三次或多次交换也可能出现，但是太少了，可以忽略。 从上图可以求出在a、b基因座之间的单交换和双交换数。 1、NPD只存在于双交换中，NPD的期望频率是DCO/4，所以双交换频率为 DCO = 4NPD 2、在双交换中四型频率 = 2NPD，在单交换中只有四型，四型总频率为SCO+2NPD，所以 SCO = T – 2NPD 3、不发生交换的频率NCO = 1 – (SCO+DCO) 4、平均交换率m是单交换率加上2倍双交换率（每个双交换含2个单交换） m = SCO + 2DCO = (T-2NPD) + 2(4NPD) = T + 6NPD 5、把m转换成图距MD MD = 50 m = 50 (T+6NPD) 例 在a b × + +杂交中，各类子囊的频率为： 56% PD，41%T和3%NPD。 求基因座之间的图距。 MD= 50 (T + 6NPD) = 50 [0.41 + (6 × 0.03)] = 50 × 0.59 = 29.5 m.u. 用重组率估计图距：因NPD子囊全都是重组孢子，T子囊一半是重组孢子，所以 RF = T/2 + NPD = 0.205 + 0.03 = 0.235 MD = 23.5 m.u. 用RF估计图距，低估了6 m.u.。这是由于RF无法校正双交换所致。只有在基因座距离较小时方可用RF作为图距。 用作图函数求图距：把重组率代入作图函数中，求出图距。 MD = -50 ln(1-2RF) = -50×ln0.53 = -50 ×0.635 = 31.74 m.u. 该结果大于29.5，原因是用作图函数求图距时，考虑了多重交换，使其结果向上偏欹。 染色体交换与四分子类型的关系 图 基因不连锁 PD = NPD 第5章 真菌类的染色体作图 5.1 两个连锁基因的作图 5.2 三个连锁基因的作图 5.3 红色面包霉染色体着丝粒作图 5.4 线性四分子分析和无序四分子分析结合使用 5.2 三个连锁基因的作图 例如：用粗糙链孢霉的两个品系杂交： arg + + × + pab thi arg(精氨酸): arginlne requirement pab(对氨基苯甲酸)：paraaminobenzoic acid requirement thi(硫胺素)：thiamine requirement 这一杂交产生9种四分子： 解：1、为了确定三个基因中每两个之间的重组频率，每两个一组，按可能的组合成三组：arg-pab，arg-thi, pab-thi，然后分别对每一组确定和计算PD、NPD及T等四分子类型的数目。 例如第(3)类四分子， 就arg-pab来说属于PD类型； 但就arg-thi来说，属于T类型； 又如第(7)类四分子，就arg-pab与pab-thi