芯片数据分析研讨.pptxVIP

数据挖掘和分析 Data Minding and Analysis;Microarray 数据分析;;;;数据分析流程图;;Microarray 数据分析;标准化处理;;数据分析流程图;数据分析流程图;背景校正;数据归一化的通用方法;1. 图像分析;信号强度分析;Ratio分析;;基因芯片的实例;;表达谱芯片分析—差异基因筛选 ;差异基因筛选的常用分析方法 ;目的：根据一种条件，筛选两组样品之间的差异基因，计算以后提供p-value（显著性值）。 要求：一个影响因素下的2组数据，每组数据3个以上生物学重复 根据不同的数据情况，t-test有三种不同的模型;The Unpaired t-test for Two Groups，多用于生物学重复之间个体差异非常小的数据； The Unpaired Unequal Variance t-Test (Welch t-test) for Two Groups，多用于生物学重复之间个体差异较大的数据； The t-test against 0 for a Single Group，用于单组数据的t-Test。 Cy3通道信号和Cy5通道信号在常规实验设计中不能独立分开作为两组单通道信号值进行数据分析。;目的：只考虑一种影响因素，筛选两组以上样品之间的差异基因。 要求：一个影响因素下的多组数据，每组数据3个以上生物学重复。 Cy3通道信号和Cy