13-硕士研究课——现代分子生物学—— 基因、基因组和基因组学-胡忠.ppt

Gene , Genome and Genomics;一、基因;;; Benzer：提出一个顺反子，一条多肽链的概念（1955年）。 Watson 和Crick：提出DNA右手双螺旋理论（1953年）。 Crick：提出中心法则（1957年）。 Jacob和Monod：提出了操纵子模型（1961年）。 Nirenberg：三联密码子学说将DNA结构与生物功能结合起来（1966年） 。 Mc-Clintock：在玉米中发现了遗传因子可以转移位置（1951年代）(1983年诺贝尔生理学奖）。 Sharp等：真核生物基因中的断裂现象（1977年）。 Feir等：发现噬菌体中重叠基因（1978年）。 ;;;2.0 nm; 泛指一个有生命体、病毒或细胞器的全部遗传物质；在真核生物，基因组是指一套染色体（单倍体）DNA，即细胞中基因以及非基因的DNA序列的总称。;二）基因组的特点;; 5. 噬菌体基因组中无内含子，但感染真核细胞的病毒基因组中具有内含子（SV40早期基因T和t） 6. 有基因重叠（同ORF重叠、异ORF重叠和反ORF重叠）。 7.大部分DNA用于编码蛋白质，只有一小部分是不翻译的。不翻译区通常是基因表达的调控序列。 8. 调控序列可以被宿主细胞所识别，其遗传密码和基因组的结构必须与宿主体系相匹配。 ;HBV 基因 结构 ;2、细菌的基因组及特点;细菌乳糖操纵子; （4） 大部分DNA是用于编码蛋白质的，只有一小部分是不翻译的。不翻译区中含有间隔区（Spacer）和基因表达的调控序列。 （5） 基因组中仅有少数基因存在基因重叠现象。 （6） 结构基因是单拷贝，rRNA基因是多拷贝。 ; 3）质粒(plasmid) （1）概念：是细菌染色体以外的遗传物质，是环状闭合的双链DNA。 （2）分类 A、按复制机理分：严紧控制型质粒，松弛控制型质粒 B、按功能分：F质粒、R质粒、Col（colicin）质粒（可产生大肠杆菌素）、Ent质粒（可产生肠毒素）。 C、按性状分：结合性质粒，非结合性质粒;（3） 质粒的一般性质;D、质粒可自行失去或经人工处理而消失（称为消除）。 E、质粒复制依赖宿主细胞的复制机器，但可以独立复制。 F、可有几种质粒同时共存在于一个细菌内，但同群质粒有不相容性（同群质粒具有同源性，可以产生相同的阻遏蛋白，故彼此间有相互抑制作用，不能共存于同一细胞）。 ;;;　 4）示例： 流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae);Abstract Science, Vol 269, Issue 5223, 496-512 Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd RD Fleischmann, MD Adams, O White, RA Clayton, EF Kirkness, AR Kerlavage, CJ Bult, JF Tomb, BA Dougherty, JM Merrick, and al. et Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, MD 21205, USA. An approach for genome analysis based on sequencing and assembly of unselected pieces of DNA from the whole chromosome has been applied to obtain the complete nucleotide sequence (1,830,137 base pairs) of the genome from the bacterium Haemophilus influenzae Rd. This approach eliminates the need for initial mapping efforts and is therefore applicable to the vast array of microbial species for which genome maps are unavailable. The H. influenzae Rd genome sequence (Genome Sequence DataBase accession number L42023) represents the only complete genome sequence from a free-