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第11章2 蛋白质的生物合成;第1节 蛋白质合成体系;一、mRNA与遗传密码;2、遗传密码; 4种碱基如何对应20种基本氨基酸?
1个碱基对应一种AA 4
2个碱基对应一种AA 16
3个碱基对应一种AA 64
——三联体密码;遗传密码表;1、方向性 5’-3’
2、简并性
除Try和Met各有一个,其他都有两个以上。
3、通用性与例外
所有生物共用一套密码。但在真核细胞线粒体中,
UAG不是终止密码子,是Trp的密码子;
AUA不是Ile的密码子,而是Met的密码子;
AGA和AGG不是Arg密码子,而是终止密码子。
4、读码的连续性;5、有起始密码子和终止密码子
起始密码子:AUG
终止密码子:UAA、UAG、UGA
6、变偶性;二、tRNA; ;;原核生物核蛋白体结构模式; ;四、翻译辅助因子;第2节 蛋白质的生物合成;一、氨基酸的活化;二、肽链合成起始; S-D序列: 在原核生物mRNA起始密码AUG上游,存在4~9个富含嘌呤碱的一致性序列,如-AGGAGG-,称为S-D序列。 又称为核蛋白体结合位点(ribosomal binding site,RBS) 能与16S核糖体RNA识别,以帮助从起始AUG处开始翻译。 ;S-D序列 ;(二)、原核生物翻译起始复合物形成;IF-3;A;IF-3;IF-3;A:aminoacyl site
P:peptide site
E:exit site(大部分在大亚基上);IF-3;指按照mRNA密码序列的指导,依次添加氨基酸从N端向C端延伸肽链,直到合成终止的过程。 ;肽链的延长是在核蛋白体上连续性循环式进行,又称为核蛋白体循环(ribosomal cycle)。
每次循环增加一个氨基酸,分为以下三步:
进位(entrance)
转肽(peptide bond formation)
移位(translocation);①进位;Tu;②转肽:肽酰转移酶(核糖体参与催化);;;延长因子EF-G有转位酶(translocase )活性,可结合并水解1分子GTP,促进核蛋白体向mRNA的3’侧移动。; ;进位;肽酰转移酶活性变为酯酶活性;原核肽链合成终止过程 ;U; ;蛋白质合成过程小结;新生多肽链不具备蛋白质的生物学活性,必须经过复杂的加工过程才能转变为具有天然构象的功能蛋白质,这一加工过程称为翻译后修饰(posttranslational modification)。
翻译后修饰包括多肽链折叠为天然的三维构象及对肽链一级结构???修饰、空间结构的修饰等。翻译后修饰使得蛋白质组成更加多样化,从而使蛋白质结构上呈现更大的复杂性。;蛋白质合成后被定向输送到其发挥作用的靶位点的过程称为蛋白质的靶向输送(protein targeting)。 ;一、多肽链折叠为天然构象的蛋白质;几种有促进蛋白质折叠功能的大分子:;1. 分子伴侣:;(1) 热休克蛋白(heat shock protein, HSP)
(2) 伴侣蛋白(chaperonin) ;(1) 热休克蛋白(heat shock protein, HSP);(2) 伴侣蛋白(chaperonin);2. 蛋白质二硫键异构酶;3. 肽-脯氨酰顺反异构酶 ;二、蛋白质一级结构修饰主要是肽键水解和化学修饰 ;四、合成后蛋白质可被靶向输送至细胞特定部位;新生蛋白质的去向:;所有靶向输送的蛋白质结构中存在分选信号,主要是N末端特异氨基酸序列,可引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位,这类序列称为信号序列(signal sequence)。
信号序列是决定蛋白质靶向输送特性的最重要元件,提示指导蛋白质靶向输送的信息存在于蛋白质自身的一级结构中。 ;N-端含1个或几个带正电荷的碱性氨基酸残基,如赖氨酸、精氨酸;
中段为疏水核心区,主要含疏水的中性氨基酸,如亮氨酸、异亮氨酸等;
C-端加工区由一些极性相对较大、侧链较短的氨基酸(如甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸)组成,紧接着是被信号肽酶(signal peptidase)裂解的位点 。;第三节 蛋白质翻译后修饰和靶向输送;靶向输送到细胞核的蛋白质其多肽链内含有特异信号序列,称为核定位序列(nuclear localization sequence, NLS) 。
NLS为含4~8个氨基酸残基的短序列,富含带正电荷的赖氨酸、精氨酸和脯氨酸,可位于肽链的不同部位,而不只在N末端。
不同的NLS间未发现共有序列; 在蛋白质进核定位后,NLS不被切除。 ;真核细胞分泌型蛋白质的靶向输送过程为:核蛋白体上合成的肽链先由信号肽引导进入内质网腔
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