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3遗传重组与转座(第3节至第4节)资料
DNA的转座(DNA transposition);主 要 内 容;;2 转座子的定义; (1) 基因组内移动;
(2) 不依赖于供体与受体间的序列关系;
(3) 一般仅移动转座子序列本身。 ; 3.1 插入序列(IS,简单转座子)
Simple transposon ( insertion sequence)
结构特征 和 转座特点
3.2 复合转座子 (Composite transposon)
结构特征 和 转座特点;插入序列(IS)的结构特征 ;In this example, the target is a 5 bp sequence. The ends of the transposon consist of inverted repeats of 9 bp. ;插入序列的转座特点;复合转座子的结构特征;A composite transposon has a central region carrying markers flanked by IS modules. ;◆通常情况,可以作为一个整体进行转座;
◆极少情况,含有的一个或两个IS元件也可进行单独转座。;所有转座子的共同机制:
在靶DNA上造成交错切口,转座子与突出的末端相连,填补缺口。 ;; 跟据转座子的移动机制,可分为:
◆复制型转座(replicative transposition)
◆非复制型转座(nonreplicative transposition)
◆保守型转座(conservative transposition);复制性转座:转座子作为可移动的元件被复制,一个拷贝保留在供体原来的部位不变;另一个拷贝则插入到受体的位点上,结果供体和受体都有一个转座子的拷贝。
;非复制型转座:转座子从供体一个位点转移到受体新位点处,供体位点留下缺口,受到损伤(严重时致死)或宿主修复系统识别修复。;
保守型转座:转座过程中,转座子没有被复制,插入到受体位点时保持核苷酸的保守性。与λ整合机制相似,也能够携带供体的DNA进入到受体DNA中。
;转座引起插入突变;
造成插入位点靶DNA的少量碱基对重复;
插入位点出现新基因;
引起染色体畸变;
切除效应;
外显子改组;① 转座引起插入突变
IS、Tn 和 Mu 噬菌体都可能引起插入突变。插入位点若在一个基因的前端功能基因中,可能造成移码或终止密码突变。;② 造成插入位点靶DNA的少量碱基对重复IS1、Tn10: 造成9bp的重复。
IS3: 造成3或4bp的重复。
IS4: 造成11bp的重复。;③ 插入位点出现新基因 复合转座子带有抗性基因(如抗药性基因ampc),可产生两方面效应:一个基因的插入突变;出现抗药基因。
;④ 引起染色体畸变 在一个染色体上(甚至不同染色体上)若有同一转座子的两个拷贝,其提供的相同重组位点,可导致缺失、倒位、插入。
方向相同:产生缺失。
方向相反:发生倒位。;;通过转座子介导的姐妹染色单体间的染色体内异位交换 ;⑤ 切除效应
指转座子从原来位置上消失。准确切除:使原插入发生恢复突变。不准确切除:留下转座子残迹,产生插入突变,但转座子标志消失。;转座子切离所造成的序列变异 ; ⑥外显子改组
当二个转座子被同一转座酶识别而整合到染色体的邻近位置时,则位于它们之间的序列有可能被转座酶作用而转座,如果这DNA序列中含有外显子,则被切离并可能插入另一基因中,这种效应称为外显子改组(exon shuffling)( 图)。
外显子改组将导致基因组中新基因的产生。 ;双转座子插入所引起的外显子改组示意图 ; 8、真核生物的转座成分; Ac和Ds这两个因子都位于玉米的第九号染色体短臂,在色素基因C的附近。
Ac因子全长4.5kb,有5个外显子,其产物是转座酶。Ac因子两端是长11bp的反向重复序列(IR);
Ds因子长0.4-4kb,它的中间(在转座酶基因中)有许多种长度不??的缺失, 如Ds9只缺失194bp,而Ds6则缺失2.5kb,Ds的两端也都有11bp的反向重复序列。
Ac和Ds的末端反向重复几乎是一样的,只有一个不同之处:Ac两端最外边的核苷酸是彼此不互补的T:G,而Ds是互补的T:A(图)。 ; Ac-Ds转座元件结构示意图。右边示Ac及Ds元件的单链DNA末端反向重复配对所形成的茎环结构,这种结构可能对转座有意义; 由于缺失转座酶,Ds因子不能自主移动,因此Ds因子是非自主
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