1导论1生物07幻灯片.pptVIP

生物信息学;教材;考核方法;Introduction to Bioinformatics;生物科学的发展阶段;实验生物学阶段（19世纪中——20世纪中）;分子生物学阶段（20世纪中期以后）;;引自J Postlethwait J Hopson著The Nature of Life，1989;Half day on the web,;2000年2月2日，北京大学燕北园300多位教师的家用计算机接入Internet；2001年2月12日，北京大学2000多个本科生宿舍的计算机接入Internet.;一、概述;Bioinformatics: 科技界一颗耀眼的新星;生物信息学;生 物 信 息 学 概 论;一. 什么是生物信息学？;早在1956年，在美国田纳西州盖特林堡召开的首次“生物学中的信息理论研讨会”上，便产生了生物信息学的概念。1987年，林华安博士正式把这一学科命名为“生物信息学”（Bioinformatics）。被尊称为“生物信息学之父”。 ; ;分子生物学和遗传学的文献积累从60年代中期的接近10万篇迅速增长至60年代末期的20多万篇，即在3-4年间，翻了一番。 此后，至80年代中期，上升至约30万篇，即平均每年增长6-7千篇。 至90年代中期，文献数已上升至40多万篇；即在10年中，平均每年增长1万篇。 到2000年，则增长至约50万篇，即在约5年间，又增长了10万篇（根据有关PubMed数据整理）。 ;美国的核酸数据库GenBank〖Banson,D.A. et al. (1998) Nucleic Acids Res. 26, 1-7〗从1979年开始建设，1982年正式运行； 欧洲分子生物学实验室的EMBL数据库也于1982年开始服务； 日本于1984年开始建立国家级的核酸数据库DDBJ，并于1987年正式服务。 从那个时候以来，DNA序列的数据已经从80年代初期的百把条序列，几十万碱基上升至现在的110亿碱基！这就是说，在短短的约18年间，数据量增长了近十万倍。; ;计算机运算速度: 18个月增长一倍;DNA序列数据: 14个月增长一倍;;分析、筛选大量新数据;生物信息学是一门新兴的、正在迅速发展的交叉学科，国内外对生物信息学的定义众说纷纭。 美国国家基因组研究中心 Bioinformatics is an emerging scientific discipline representing the combined power of biology, mathematics, and computers. 美国乔治亚理工大学 Bioinformatics is an integration of mathematical, statistical and computer methods to analyze biological, biochemical and biophysical data.;美国密苏里大学 Bioinformatics is the science and technology about learning, managing and processing biological information. 美国加利福尼亚大学洛杉矶分校 Bioinformatics is the study of the inherent structure of biological information and biological systems. It brings together the avalanche of systematic biological data with the analytic theory and practical tools of mathematics and computer science. ; 生物信息学（bioinformatics）是生物学与计算机科学以及应用数学等学科相互交叉而形成的一门新兴学科。它通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析，进而达到揭示数据所蕴含的生物学意义的目的。 ;生物信息学是多学科交叉产生的一门新兴学科;在推动生物信息学发展的各种动力中，人类基因组计划（HGP）和生物医药工业是其中的两个主要力量。现代分子生物学的发展，特别是人基因组计划的实施，使生物学家所面对的数据不再是实验记录本上或文献上的几行简单数字，而是公共数据库中数以千兆计的记录。 由于当前生物信息学发展的主要推动力来自分子生物学，生物信息学的研究主要集中于核苷酸和氨基酸序列的存储、分类、检索和分析等方面，所以目前生物信息学可以狭义地定义为： 将计算机科学和数学应用于生物大分子信息的获取、加工、存储、分类、检索与分析，