第九章 放射性核酸探针的制备及应用.pptVIP

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第九章 放射性核酸探针的制备及应用

第九章 放射性核酸探针的制备及应用;一、双链DNA探针 1、切口平移法(Nick translation) 2、随机引物合成法 二、单链DNA探针 1、从M13载体衍生序列合成DNA探针 2、从RNA合成单链cDNA探针 三、末端标记DNA探针 1、3,末端标记 2、5,末端标记 (1) 前向反应(Forward reaction) (2) 交换反应(Exchange reaction) 四、寡按苷酸探针 1、 T4多核苷酸激酶标记 2 、末端转移酶标记(Altar等,1989) 3、 Klenow片段标记 五、RNA探针 ;第二节 放射性核酸探针在分子生物学研究中的应用 放射性核素(32P、3H、35S或125I)标记的核酸探针,已成为分子生物学研究的重要工具。 它的利用,使得人们能够从分子水平上直接进行遗传物质的检测(即基因的定位、定量和顺序分析)以及重组DNA中目的片段的鉴定。这已成为同位素示踪技术的一项新的内容。 放射性核素探针与分子杂交技术相结合,可以用来鉴别重组子、分离基因、分析DNA片段、研究基因表达。 本节主要介绍放射性核酸探针在分子生物学研究中的应用,同时介绍有关分子杂交的部分内容。 ;一、分子杂交的基本原理 互补的核苷酸序列通过Watson-Crick碱基配对而形成稳定的双链分子的过程称为杂交。 形成杂交分子的前提是核酸单链之间具有一定的互补序列(即有某种同源性)。 分子杂交是通过印迹将核酸分子固定在固体支持物上,然后用放射性标记或非放射性标记的探针与被固定的分子杂交,经显影显示出目的DNA或RNA分子所处位置。 ;二、Southern杂交;Middle;三、放射性核酸探针在分子生物学研究中的应用 (1)筛选载体 外源DNA需要与某种工具重组,然后才能导入宿主细胞中进行克隆和保存或表达外源DNA中的遗传信息,这种将外源DNA携带进入宿主细胞的工具称为载体。根据核酸序列的同源性,利用放射性核酸探针与转化后宿主细胞中的质粒或噬菌体进行杂交,可以筛选出重组的质粒或噬菌体。从而实现重组载体的筛选。 (2)检测基因表达 细胞核内的DNA片段通过转录形成mRNA并释放到细胞质中。被检测基因在细胞中的转录情况可以进行如下分析: ① Northern杂交 检查细胞中是否含有特定的mRNA,测定特定mRNA在总RNA中的???例,由此获得目的mRNA的转录情况。 ② 斑点杂交 应特异性探针检测mRNA,并估计表达过程中mRNA的转录程度。;(3)筛选基因文库 由于在构建文库的工作中需要筛选大量的重组子,通常都采用杂交进行筛选,以便在较短的时间内获得阳性克隆。用DNA片段作为探针进行杂交的溶液主要有:甲酰胺;水溶液。这两种溶液都能得到良好的结果。 (4)鉴定作物品种 由于不同品种的作物,其DNA和mRNA存在着差异,因此用特定的核酸探针进行不同品种间的分子杂交,可得到不同品种在遗传物质上的差异。 (5)诊断与鉴定病害 在病害的诊断和鉴定中,核酸探针技术被认为是一种非常有力的手段。它不仅能确定染色体组的组成和基因的功能,而且为病毒的诊断和确定病毒间的关系提供了新途径。 (6)加快DNA序列分析 对大片段的DNA进行序列分析时,可用限制酶将它酶切成小片段,再用已知序列的核酸探针进行杂交,测定它们间的同源性。这样可以大大加快序列的测定过程。

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