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微生物实验报告2
实验目的、原理、材料、内容、结果、分析讨论
实验目的
嗜热链球菌的筛选、分离鉴定及发育树鉴定
实验原理
乳酸菌是一类能利用可发酵的糖产生大量乳酸的细菌通称。这类细菌广泛分布在土壤 植物根、茎、湖泊及动物的体内。乳酸菌从形态上可以分为球菌和杆菌,并且均为革兰氏染色阳性。在缺少氧气的环境中生长良好的兼性厌氧菌或厌氧性细菌。
嗜热链球菌来源于乳制品。它是一种耗氧的革兰氏阳性菌,以两个卵圆型为一对的球菌连成约0.7到0.9微米的长链。在选择性培养基,嗜热链球菌会长成米色的菌落。嗜热链球菌也可在含有下列任一种糖类的培养基上生长。这些糖类包括半乳糖、葡萄糖、果糖、乳糖、蔗糖。 乳糖的降解需要一种特殊的酶,叫β-半乳糖苷酶。乳糖不耐受的人身体内就是缺乏了这一种酶。嗜热链球菌是一种能产生β-半乳糖苷酶的细菌,所以可以帮助乳糖的消化。 嗜热链球菌个体中多有2球体连接、3、4球体连接、5、6球体连接的8球体以上连接的和单球体的少见。所以个体大小差距较大。多在0.4-0.71.0-6um范围内。
传统的分类形态特征,这些方法在分类鉴定中发挥过重要作用,但也存在着鉴定准确性差、繁琐耗时等缺点。, 各种基因型分类方法也应运而生, 如(G+ C)mo l%、DNA 杂交、rDNA 指纹图、质粒图谱和16Sr DNA 序列分析等等。细菌16S rDNA以及丝状真菌的核糖rDNA内部转录间隔区(Internal Transcribed Spacer, ITS)序列分析鉴定已经被大多研究者所采用,。rRNA , 它含量大(约占细菌RNA 总量的80% ) , 并存在于所有细菌中。rRNA 基因由保守区和可变区组成, 在细菌中高度保守, 素有“细菌化石”之称, 是细菌系统分类学研究中最有用和最常用的分子钟。原核生物的rRNA 分为3 种, 分别为5S rRNA、16S rRNA 和23S rRNA , 并且它们位于同一操纵子上。 rRNA 的基因在大多数原核生物中都具有多个拷贝, 拷贝数目从1 到14 不等。其中, 16S rDNA 序列分析已经成为细菌种属鉴定和分类的标准方法, 大约2500 个种的16S rDNA 全序列已经被报道。根据它们的序列同源性, 已经构建了各种属的系统发育树。 也是进行微生物资源快捷鉴定的重要方法。
16S rDNA以及ITS序列的扩增需要染色体DNA作为模板。提交至NCBI-BLAST网站进行序列比对17琼脂培养基:蛋白胨10.0g、牛肉膏5.0g、酵母浸膏2.5g、抗坏血酸0.5g、硫酸镁0.25g、甘油10.0g、磷酸甘油二钾5.0g、乳糖3.0g、琼脂11.0g、蒸溜水1000ml
DNA扩增溶液体系:16sRNA上游引物、16sRNA下游引物、Taq酶
溶液和试剂:去离子水、结晶紫溶液、碘液、95%酒精、刚果红溶液
仪器:超净工作台、高压灭菌锅、培养箱、 显微镜、PH试纸、分析天平、移液枪及枪头、EP管、PCR仪、电泳仪、烧杯、量筒、锥形瓶、接种环、水浴锅、培养皿、纱布、绳子、试管、酒精灯、培养箱
实验内容
培养基的配置与灭菌:准备仪器,并按照培养基培养,配置1000ml改良型M17琼脂培养基,倒100ml于锥形瓶中,盖8层纱布后,于高压灭菌锅121℃灭菌30min。配置5根装有4.5ml去离子水的试管,也置于灭菌锅灭菌。其他相关仪器也一同灭菌。
培养基的制备:将灭好菌的培养基溶液,在没有凝固前,在无菌条件下导入培养皿,培养基凝固待用。
原材料准备:购买光明畅游酸奶一瓶,并在无菌条件下抽取0.5ml,置于装有4.5ml去离子水的试管中,制成为10-1浓度的原料液,然后再从此试管中,吸取0.5ml置于装有4.5ml去离子水的试管中,制成为10-2浓度的原料液,以此进行,制成10-6浓度的原料液。
菌体培养:吸取1.5ml 10-6浓度的原料液均匀涂洒在培养基上,与培养箱中37℃培养24h。
观察形态并染色:取出已经培养24h的培养基,观察该培养基,鉴别该培养基上长出的菌落,挑选出进行染色,观察形态。
分离纯培养:于无菌环境,挑起长出的菌落,接种到另一个培养皿中,继续与培养箱中37℃培养24h。
观察形态及鉴别是否为纯种:取出培养皿,挑取菌落,染色并观察形态。挑选出嗜热链球菌菌落。
菌体模板的制作:吸取200μl的去离子水到灭菌的EP管中,在无菌条件下,用接种环挑取少量菌体到水中,100℃水浴5min。
PCR反应体系的制备:按照比例24μl 去离子水、1 μl模板、2.5μl上游引物、2.5μl下游引物、30μl 2×Taq酶制备60μl的反应体系,并以20μl为一管,分装到3个EP管中。
PCR扩增:将EP管置于PCR仪进行扩增。PCR反应条件为:94℃预变性min;94℃变性30
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