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第14章 RNA的生物合成-转录RNA Biosynthesis--Transcription
转录(transcription): 以DNA为模板,在RNA聚合酶(RNA polymerase)的作用下合成mRNA,将遗传信息从DNA分子上转移到mRNA分子上,这一过程称为转录(transcription)。
1、转录是基因表达的中心环节
转录是以 DNA为模板合成RNA, 并且只是以单股DNA 为模板,因此具有不对称性;
用以转录的单链DNA, 称为模板链, 与复制不同,转录是局部的,从启动子开始到终止子结束,为一个转录单位;
转录不需要引物;
转录的忠实性相对弱;
转录首先得到RNA前体,然后再进行加工转变为成熟的RNA.
被转录成单个RNA分子的一段DNA 称为一个转录单位(transcript)
分子量48万,5种亚基:
全酶= 核心酶(α2ββ’)+ σ因子
α亚基决定转录的基因
β亚基在5’——3’方向上延长多核苷酸链,其方式与DNA 聚合酶相同,原料为NTP,没有纠错的功能。
β’亚基结合DNA模板
σ因子识别启动子并与之结合
2、 RNA聚合酶( RNA polymerase )
2.1、原核的RNA聚合酶
聚合酶I :转录45S rRNA
聚合酶II:转录mRNA的前体,称为核不均RNA(hnRNA)
聚合酶III:转录tRNA 和5S rRNA 等
2.2、真核的RNA聚合酶
DNA上的转录起始序列,称为启动子,有序列保守性,不仅是转录起始的位置,而且影响转录的活性。
RNA聚合酶结合在启动子上
上游
下游
3、 启动子( promoter )
注意原核启动子在-35 和-10区域的保守序列
Pribnow box
真核转录启动子的保守序列
(TATA box,TATA盒)
并非所有的真核基因都有典型的TATA box,不同生物的基因有不同的上游DNA序列
4.1、转录开始
由σ因子辨认并且结合到启动子上,局部解链(10-20bp),拓朴酶等也参与。
4.2、RNA链的延伸
由核心酶催化,以其中的一股DNA 单链作为模板链,以NTP为原料,按照碱基互补配对的原则,通常是由5’ppp嘌呤核苷(G 或A )开头向着3’延长多核苷酸链,合成开始后,σ因子从模板上脱离下来(可以重复利用)。
核心酶覆盖双链DNA和RNA复合物,向前推进,一边解开螺旋,一边释放出新合成的RNA链,后面已经转录的区域中分开的DNA链又重新形成双螺旋。
4、转录过程及其特点
“转录泡(transcription bubble)”
转录过程中的模板识别、起始和延伸
A. 依赖ρ因子的终止
新生RNA上有ρ因子的识别位点。它与聚合酶-DNA-RNA复合物结合,向3’端移动,并解开DNA-RNA杂交体,需ATP。
B. 依赖于特定序列的终止
转录终止区有特殊结构。终止区的上游有GC二重对称区,转录的RNA容易形成多个“发卡”结构,转录产物的3’端有polyU序列。这种特殊的二级结构阻止了转录向下游继续推进。
4.3、转录的终止
A
B
转录得到的只是初级产物,通常要经过加工,才能转变为成熟的RNA。tRNA 和rRNA的转录后加工比较简单,而mRNA 的转录后加工比较复杂。
原核基因是多顺反子(poly-cistron),通常是几个相关的结构基因(编码的)同时转录得到多个mRNA。
而真核基因是单顺反子(mono-cistron),又是断裂基因。其结构基因中由编码的外显子(exon)和不编码的内含子(intron)间隔排开。转录得到的是“毛坯”,要在其5’端加上鸟嘌呤“帽子”,3’端加上polyA的“尾巴”,切除内含子,拼接外显子,才能成为一个成熟的mRNA。
5、RNA后的加工( post-transcriptional processing)
原核前体RNA的加工
tRNA转录后的加工与修饰
注意稀有碱基
真核rRNA前体转录后的加工
真核mRNA前体转录后加工(以卵清蛋白mRNA的转录为例)
外显子
内含子
首、尾部的修饰
1)5‘端形成帽子结构(m7GpppGp-)
2)3‘端加上多聚腺苷酸尾巴(polyA tail)
真核生物mRNA的转录后加工
帽子结构
在原生动物四膜虫(tetrahymena)中
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