MPICH;PBS用户使用指南.docVIP

MPICHPBS使用指南 一、MPI编程 1 二、MPICH下编译和运行 3 三、PBS环境下运行 4 一、MPI编程 1、MPI编程函数介绍 MPI实际上是一个提供并行程序消息传递机制的函数库，有40多个函数，常用的有6个基本函数。下面以C语言为例简单介绍这些函数。 （1）MPI_Init函数 定义：int MPI_Init int *argc, char ***argv 功能：用命令行参数初始化MPI环境 输入：argc、argv—表示命令行参数，同C语言的main 函数参数格式，argv中包含欲并行运行的进程数 输出：返回值—非零/零表示初始化是否成功 说明：该函数必须为程序中第一个调用的MPI函数 示例：MPI_Init argc, argv ; // argc、argv引用的是mian 函数的参数 （2）MPI_Finalize函数 定义：int MPI_Finalize void 功能：结束MPI程序的运行，指结束MPI环境的使用 输入：无 输出：返回值—非零/零表示结束MPI环境是否成功 说明：该函数必须为程序中最后一个调用的MPI函数 示例：MPI_ Finalize ; （3）MPI_Comm_size函数 定义：int MPI_Comm_size MPI_Comm comm, int *size 功能：得到总进程数 输入：comm 通信域句柄（系统默认的为MPI_COMM_WORLD，也可自己定义） 输出：size，即通信域comm内包括的进程数整数 （4）MPI_Comm_rank函数 定义：int MPI_Comm_rank MPI_Comm comm, int *rank 功能：得到本进程的进程号 输入：comm，该进程所在的通信域句柄 输出：rank，调用进程在comm中的标识号 （5）MPI_Send函数 定义：int MPI_Send void* buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dest, int tag, MPI_Comm comm 功能：发送消息给特定的进程 输入：buf 发送缓冲区的起始地址 可选类型 count 将发送的数据的个数 非负整数 datatype 发送数据的数据类型 句柄 dest 目的进程标识号 整型 tag 消息标志 整型 comm 通信域 句柄 输出：无 （6）MPI_Recv函数 定义：int MPI_Recv void* buf, int count, MPI_Datatype datatype, int source, int tag,MPI_Comm comm, MPI_Status *status 功能：接受别的进程发过来的消息 输入：count 最多可接收的数据的个数 整型 datatype 接收数据的数据类型 句柄 source 接收数据的来源即发送数据的进程的进程标识号 整型 tag 消息标识与相应的发送操作的表示相匹配相同 整型 comm 本进程和发送进程所在的通信域 句柄 输出：buf 接收缓冲区的起始地址 可选数据类型 status 返回状态 状态类型MPI_Status 2、MPI程序示例 MPI程序中必须包含MPI库的头文件，C语言头文件名为mpi.h，FORTRAN语言头文件名为mpif.h。 /* helloworld.c程序清单*/ #include “mpi.h” main int argc, char **argv int numprocs,myrank,i,j,k; MPI_Status status; char msg[20]; MPI_Init argc,argv ; MPI_Comm_size MPI_COMM_WORLD,numprocs ; // MPI_Comm_rank MPI_COMM_WORLD,myrank ; if myrank 0 strcpy msg,”Hello World” ; MPI_Send msg,strlen msg +1, MPI_CHAR,1,99, MPI_COMM_WORLD ; else if myrank 1 MPI_Recv msg,20,MPI_CHAR,0,99,MPI_COMM_WORLD,status ; printf “Receive message %s\n”,msg ; MPI_Finalize ; 二、MPICH下编译和运行 1、编译 MPICH环境下，程序的编译采用命令行方式，即在Linux命令行下用mpicc命令进行编译。 编译命令格式：mpicc –o 可执行文件名 源程序文件名 命令参数说明： 1 源程序文件经过mpicc编