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分子生物学检测及动物试验研讨
一、细菌DNA由四个碱基组成: 鸟嘌呤(G) 腺嘌呤(A) 胞嘧啶(C) 胸腺嘧啶(T) 严格的碱基配对: A=T G=C 常以G+C碱基对的摩尔百分比来测定细菌DNA四个碱基对的含量来鉴定细菌。 二、细菌DNA提取过程 (一)细菌的培养及细菌收集 细菌培养:液体培养,固体培养 细菌收集:一般要求收集2-3克湿菌体 (二)细菌破壁 1. 超声波破壁法 2. 氧化铝磨碎法 3. 反复冻融法 4. 化学试剂破壁法,十二烷基磺酸钠“SDS” 5. 溶菌酶溶解法 6. 其他方法:细菌研磨法、玻璃珠研磨法。 三、细菌DNA的提取方法 (一)Marmur氯仿提取法 吸出上层含核酸的水相 注意: 1. 被溶解的细菌浓度不能太低。 2. SDS为阴离子去污剂,各厂家、批号、等级差异较大。 3. 离心分层后,取水相液体要准确。 (二)细菌DNA中G+C摩尔百分比测定 1. 化学方法 用电泳和层析等技术 2. 物理方法 用热变性温度(目前常用方法) G+C摩尔百分比测定,是细菌分类鉴定的一种重要方法。缺点:不能表达出DNA碱基的排列顺序。 核酸杂交技术 核酸杂交技术(technique of nucleic acid hybridization)是由现代分子生物学的重要方法之一。 是用特定标记的已知核酸序列与待测核酸进行特异性的杂交结合,形成杂交体,并利用相应的显示技术来检测目标核酸的存在及其位置的分子生物学方法。 一、核酸探针(DNA探针) 就是指带有标记物的,能与特定核酸序列发生特异性互补的已知核酸序列片段。 (一)核酸探针的种类 1. NDA探针 DNA探针是目前最常用的核酸探针,因具有三 大优点: 这类探针克隆在质粒载体上,可无限繁殖,取之不尽; DNA探针与RNA探针相比,不易降解,一般能抑制DNA酶活性; DNA探针标记方法较成熟,制备方法简便。 2. CDNA探针 CDNA是指互补于mRNA的DNA分子(complementary DNA), CDNA是由RNA经反转录产生的,这种DNA探针不含有内含子序列,尤其适用基因表达检测。 3. RNA探针 是一类很有前途的核酸探针,常用细胞mRNA和病毒RNA, 具有高杂交效率。但易降解,标记复杂之缺点。 4. 寡核苷酸探针 根据某一特殊核酸序列,选择其中最稳定区域,经人工合成,为18~30个碱基,能识别一个碱基。 二、标记物 32P 半衰期 14.3d 35S 半衰期 87.1d 14C 半衰期 125I 半衰期 60d 三、基因重组载体 载体的功能是将一个外源基因导入受体细胞 具体的条件 1. 其本身是复制子,能自我复制。 2. 分子量小,带有选择标记。 3. 对几种限制性内切酶有单一切点。 4.并有一定非必要区,允许外源基因插入。 Southern 印迹杂交 两个主要过程: 一是将待测核酸分子通过一定方法转移并结合到一定的固相支持物上(即印迹,blotting)。 二是固定于膜上的核酸同标记的探针在一定温度和离子强度下退火(复性)即分子杂交过程。 一、待测核酸样品的制备 二、琼脂糖凝胶电泳分离待测DNA 三、转膜 四、杂交 (一)预杂交 DNA片段与探针进行杂交前必须先进行预杂交,因能结合DNA片段的膜,同样能结合探针DNA,所以须将膜上所有能与DNA结合的位点全部封闭。 (二)正式杂交 五、放射性自显影 用放射性同位素标记dNTP(2’-单脱氧核苷酸),测定核酸序列是应用最早。 Northern 印迹杂交(Northern blotting) 一、原理: 是将RNA样品通过琼脂凝胶电泳进行分离 ,再转移到固相支持物上,用带标记物的探针对固相膜上的RNA进行杂交,常用于RNA病毒核酸的检测。 二、步骤 原 位 杂 交 是用特定标记的已知顺序核酸为探针,与细胞或组织中的核酸进行杂交,此杂交能保持细胞的完整性,但能对细胞或组织中的核酸进行定性、定位测定。 斑 点 杂 交 硝酸纤维素膜具有吸附单链DNA或RNA的特性,可将样品直接点在样品膜上,经变性,固定后进行杂交,称斑点杂交(dot blot hybridization)。 免疫印迹法(immunoblot) 免疫印迹法,也称免疫转印技术。 1975年southern首先用于分析核酸,故称核酸印迹,southern blot。 1977年Alwine将此法用RNA研究,取名Northern blot 1979年To
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