基因组学__7.1.基因的表达调控试题.ppt

2008-3-10 中英联合实验室 基因的转录调控 原核生物与真核生物基因表达方式的主要区别 原核生物：基因的转录与mRNA的翻译偶联，转录与翻译同步进行，不存在mRNA的加工问题； 真核生物： 转录与翻译在空间上是隔离的，转录在细胞核中进行，转录的产物加工后输出到细胞质，由游离在细胞质中或定位于内质网上的核糖体将mRNA译成蛋白质 转录初级产物要经过许多加工与修饰才能成为成熟的mRNA ，未成熟的mRNA不能输出细胞核。 一.原核基因的转录调控 转录起始调控 组成型调控，主要依赖于启动子的结构； 调节型控制，主要依赖于调控蛋白的活性。 转录延伸与终止调控 组成型调控：启动子决定基因转录起始的基准水平 RNA聚合酶：核心酶与σ 因子 -35盒框主要影响σ因子的识别以及聚合酶附着的速率 -10盒框与转录起始复合物从封闭状态转向开放状态有关 下游50bp内的核苷酸顺序 一.原核基因的转录调控 调节型控制 负调控：阻遏物与DNA分子结合 阻碍RNA聚合酶转录 使基因处于关闭状态； 正调控：诱导物通常与蛋白质结合 形成一种激活子复合物 与基因启动子DNA序列结合 激活基因起始转录 使基因处于表达状态。 一.原核基因的转录调控 大肠杆菌乳糖操纵子模型 ----结构基因(structural gene, SG) ：操纵元中被调控的编码蛋白质的基因 ----启动子(promoter，P)：是指能被RNA聚合酶识别、结合并启动基因转录的一段DNA序列。 ----操纵基因(operator，O)：是指能被调控蛋白特异性结合的一段DNA序列。 转录延伸 转录延伸时RNA聚合酶沿模板链滑行，始终保持着一个向前移动的转录泡，12-20bp RNA聚合酶一边在前面解开双螺旋，同时又在后面将双螺旋回复 合成速率：RNA 40bp/s，氨基酸 12个/s 转录终止：热力学最佳状态 内终止子：大肠杆菌中促使转录终止的DNA位置有一段反向回文顺序，其后紧接一串腺嘌呤核苷酸（A-U配对，稳定性较差）。内终止子指导合成的RNA产物与模板结合不稳定 Rho依赖型： Rho--解旋酶，使DNA与RNA之间的配对碱基分开。形成发夹结构，但不太稳定，其后也缺少一串腺嘌呤，借助Rho 转录延伸与终止调控 抗终止antitermination：RNA聚合酶遇到终止信号时可无视其存在继续前进， 直至第二个终止信号出现。同一启动子下数个基因。RNA聚合酶是否停止，需要借助一个抗终止子蛋白。 衰减（attenuation） ，主要涉及与氨基酸合成有关的操纵基因。色氨酸操纵基因启动子下游有一段引导顺序（50-60bp有2个色氨酸密码子），终止信号位于100-140bp之间，可形成发夹结构，但取决于聚合酶与核糖体之间的相对位置。 二.真核基因的转录调控 RNA聚合酶 依赖于DNA的RNA聚合酶 依赖于RNA的RNA聚合酶：与某些病毒基因组的复制与表达有关 独立于模板的RNA聚合酶：poly（A）聚合酶 RNA聚合酶Ⅰ、RNA聚合酶Ⅱ 、RNA聚合酶Ⅲ 二.真核基因的转录调控 转录因子 真核RNA聚合酶不能直接接触启动子，必须依赖转录因子在启动子区构筑“平台”后，才可进入启动子区，参与转录起始复合物的组装 原核RNA聚合酶与启动子亲和力强，几乎所有启动子的转录起始基准水平都相对较高；真核转录起始基准水平都很低 普遍性转录因子：将RNA聚合酶定位在核心启动子，是转录起始复合物的组成成员 激活转录因子：影响转录起始复合物的组装及转录速率，决定某一基因是否表达。 二.真核基因的转录调控 每一个真核生物基因组由成千上万个基因构成 看家基因始终处于活化状态 大多数基因在时间上和空间上选择性表达，生物体才能够有条不紊生长发育 时间：发育阶段 空间：组织、器官 二.真核基因的转录调控 真核基因表达调控的层次 ①DNA和染色体水平的调控 基因扩增、基因丢失、基因重排、基因修饰、基因封闭等。 ②转录水平的调控 转录的起始、延伸和终止等。 ③转录后RNA前体加工及转运的调控 基因在核中转录而在胞浆中翻译，转录后需经剪切、拼接、编辑、修饰和转运等过程。 ④翻译水平的调控。 ⑤翻译后水平的调控。 翻译产物剪切、修饰、构象形成、转运和装配等。 ⑥mRNA降解的调控 细胞内有控制mRNA寿命的机制。 二.真核基因的转录调控 1. DNA和染色体水平的调控 DNA水平规律性变化也参与了生物体发育的调节。 染色质结构与基因活化（基因封闭） 核基质附着区与基因表达 基因丢失 基因扩增 基因重排 基因修饰 二.真核基因的转录调控 染色质结构与基因活化 染色质：间期细胞内遗传物质的存在形式，由DNA、组蛋白、非组蛋白及少量RNA组成的线性结构 染色质结构的变化与基因能否表达紧密联系，基因要得以