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药物基因组学: 根据不同个体间的基因组差异与基因多态性,阐明个体间在药物代谢和效应方面发生差别的遗传基础。 不同的个体间药物的疗效和副作用存在差异。 促使新药的发现。 根据个体的遗传背景来优化药物治疗方案,即“个体化治疗”。 四、HGP 1.HGP的由来: 1972-1982年美国庞大肿瘤研究计划最后失败使人们思考从另外一个角度解决问题 1983年,美国能源部负责核武器研制的两个国家实验室提出,要研究日本广岛、长崎幸存者基因突变情况,必须把人30亿碱基对搞清楚 1984年12月美国能源部讨论此方案,1986年3月决定实施 * ④调控序列(可位于上述2种序列中) * 。 国际人类基因组测序联盟和CELERA * 基因组学(genomics) 授课:易静(yijing@) 兰州大学生命科学学院 教材及参考书 教材: 基因组学(第2版),杨金水编著,高等教育出版社,2007 参考书: 1、基因组3 (Genome 3)T.A.布朗著,袁建刚等翻译,,科学出版社,2009 2、基因组学 宋方洲主编 军事医学科学出版社 2011 本学期所学内容 第1章 基因组 第2章 遗传图绘制 第3章 物理图绘制 第4章 基因组测序与序列组装 第5章 基因组序列注释 第6章 基因组解剖 第10章 基因组表观遗传 第13章 基因组进化的模式 第14章 基因组与生物进化 一些基因组研究的网站 /genome / / / / / / ...... 一、基本概念 1. 基因(gene) coined by W. Johannsen in 1909,(希腊文genos,给予生命) a locatable region of genomic sequence, corresponding to a unit of inheritance, which is associated with regulatory regions, transcribed regions, and or other functional sequence regions 是储存和表达某一多肽链信息或RNA分子信息所必需的全部核苷酸序列,是遗传的基本结构和功能单位 A typical eukaryotic gene Coding regions: exons(untranslated region:5UTR,3UTR) Noncoding regions:introns Regulatory regions:promoters, enhancers 一、基本概念 2. 基因组(genome) coined by German botanist Hans Winkler in 1920,from gene+chromosome 原始定义是指“all the genes comprising a haploid set of chromosomes”,即单倍体细胞中整套染色体上的所有基因 更准确的定义 the entire genetic material of an organism”即生物中携带遗传信息的遗传物质的总和 可以分为eukaryotic genomes (nuclear genomes, mitochodrial genomes, chloroplast genomes),prokaryotic genomes(chromosome and plasmids) and virus genomes 3. Genomics coined by T.H.Roderick in 1986 “mapping, sequencing and characterizing genomes” ,即基因组作图(包括遗传图谱、物理图谱、转录图谱),核苷酸测序及序列分析、基因定位和基因功能分析。 简单说来,genomics就是在全基因组范围内研究基因结构、组成、功能及进化的一门学科 其他组学(-omics) 研究细胞、组织或整个生物体内某种分子的所有组成内容,称为组学。 例如 trancriptomics, proteomics,metabolomics,ribo-gnomics(小RNA组学),spliceomics(剪接物组学), phenomics(表型组学)等等 二、基因组学分类 结构基因组学(structural genomics) 通过基因组作图、核苷酸序列测定及序列分析来研究基因组结构的一门学科 另一种定义:结构基因组学(又称为结构蛋白质组学)是指研究整个基因组所编码的所有蛋白质分子

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