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人工基因组的设计与合成-复习课详解
人工基因组的设计与合成
李炳志
2014-04-20
1 核酸与基因
2 基因表达与调控
3 现代生物技术
4 人工合成酵母染色体
复习大纲
DNA是遗传物质,而蛋白质不是遗传物质。
核酸的化学组成
核酸的基本组成单位
——核苷酸
DNA结构特点
1 核酸与基因
Watson 和 Crick 于1953年提出了DNA 双螺旋结构模型,说明了DNA 的二级结构。(即B型DNA)
DNA二级结构
DNA双螺旋结构模型要点(1)
螺旋中的两条链反向平行,即其中一条链的方向为5’→3’,而另一条链的方向为3’→5’,两条链共同围绕一个假想的中心轴呈右手双螺旋结构。
疏水的碱基位于双螺旋的内侧,亲水的磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。碱基平面与螺旋轴垂直,脱氧核糖平面和碱基与中心轴平行。由于几何形状的限制,碱基对只能由嘌呤和嘧啶配对,即A与T,G与C。这种配对关系,称为碱基互补。
DNA双螺旋结构模型要点(2)
磷酸和脱氧核糖是双螺旋的骨架
A和T之间形成两个氢键,G与C之间形成三个氢键。
碱基配对决定了核酸的特异性
DNA双螺旋结构模型要点(3)
由于碱基对排列的方向性,使得碱基对占据的空间是不对称的,因此,在双螺旋的表面形成大小两个凹槽,分别称为大沟和小沟,二者交替出现。
DNA双螺旋结构模型要点(4)
双螺旋横截面的直径约为2nm,相邻两个碱基平面之间的距离(轴距)为0.34nm,每10个核苷酸形成一个螺旋,其螺距(即螺旋旋转一圈)的高度为3.4 nm。
DNA双螺旋结构模型要点(5)
两条链借碱基之间的氢键和碱基堆积力(即碱基之间的范德华力)牢固的连接起来,维持DNA双螺旋的三维结构。
两条链是互补关系。
中心法则
复制
1 核酸与基因
特点一:DNA的半保留复制
以亲代DNA双链为模板以碱基互补方式合成子代DNA,这样新形成的子代DNA中,一条链来自亲代DNA,而另一条链则是新合成的,这种复制方式叫半保留复制。
DNA复制的特点
半保留复制
DNA半保留复制图示:
特点二:DNA的复制是半不连续的
DNA 复制在合成前导链(leading strand) 时是连续的;而在合成滞后链(lagging strand)时是先形成冈崎片段( Okazaki fragment ),随后再将它们连接而成大片段。因滞后链是不连续合成的而先导链是连续合成的,所以我们称之为半不连续复制(semidiscontinuous replication)。
先导链
滞后链
冈崎片段
转录 (transcription)
以DNA的一条链为模板合成一条互补的RNA的过程 。
转录
转录的特点
不对称转录(asymmetric transcription): 在DNA分子双链上某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录 。
转录单元:一段被转录成单链RNA的 DNA序列,它起始于启动子,结束于终止子。
转录过程只以基因组DNA中编码RNA(mRNA、tRNA、rRNA及小RNA)的区段为模板。把DNA分子中能转录出RNA的区段,称为结构基因。
编码链(coding strand):与模板链相对应的互补链,其编码区的碱基序列与mRNA的密码序列相同(仅T、U互换),也称作Crick(C)链(Crick strand)、正(+)链(plus strand),或有意义链(sense strand)。
模板链(template strand):DNA双链中仅有一股链作为模板转录成RNA,也称作Watson(W)链(Watson strand)、负(-)链(minus strand)或反意义链(antisense strand)。
转录的四个阶段
转录可以分为4个阶段:模板识别、起始、延伸和终止。
蛋白质生物合成的概念
蛋白质生物合成(protein biosynthesis)也称翻译(translation),是生物细胞以mRNA为模板,按照mRNA分子中核苷酸的排列顺序所组成的密码信息合成蛋白质的过程。
定义
翻译——肽链的生物合成过程
从mRNA的起始密码子AUG开始,按5ˊ→3ˊ方向逐一读码,直至终止密码子。于是,合成中的肽链从起始甲硫氨酸开始,从N端→C端延长,直至终止密码子前一位密码子所编码的氨基酸。
遗传密码的特点
1. 方向性(directional)
翻译时遗传密码的阅读方向是5’→3’,即读码从mRNA的起始密码子AUG开始,按5’→3’的方向逐一阅读,直至终止密码子。
2. 连续性(non-punctuated)
编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码子及密码子的各碱基之间既无间隔也无交叉。
3. 简并性(degene
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