RNA测序研究进展(精选).docVIP

成绩 基因组学课程论文 RNA测序的研究进展 薛璐 学 号专 业：生物技术 班 级：生物技术一班 论文提交日期 2011 年 10 月19日 RNA测序的研究进展 薛璐 （ 黑龙江大学 哈尔滨 150080继人类基因组计划完成后，RNA又成为分子生物学研究的一个新的热点和焦点，在短短几年内已取得突破性的进展，RNA sequencing research progress Xuelu (The first class of Biological technology , College of Life Science, Heilongjiang University, Harbin,150080) Abstract：Following the completion of human genome project, RNA and become molecular biology research of a new hotspot and focus, in a few short years has made breakthrough progress, and research progress in RNA, RNA sequencing technology is the most important and the most is one of the key technology, this paper introduced the principle and method of RNA sequencing, and also to summarize the current research progress of RNA sequencing, RNA sequencing in the biological research holds the very important position, the RNA sequencing gene expression and has become an important means new transcriptomic analysis. So with the development of science and technology, RNA sequencing technologies will more and more mature, and appear important role. Key words：RNA Sequencing Research Progress 正文： 在生物学研究中，随着新一代高通量DNA测序技术的快速发展，RNA测序(RNA-seq)已成为基因表达和转录组分析新的重要手段，并且随着RNA的重要性逐渐被人所认识，研究人员也开发出多种方法来研究它。自2005年以来，以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的SOLiD 技术为标志的新一代测序技术相继诞生，新一代测序技术又称作深度测序技术，主要特点是测序通量高，测序时间和成本显著下降。把这种高通量测序技术应用到由mRNA 逆转录生成的cDNA上，从而获得来自不同基因的mRNA片段在特定样本中的含量，这就是mRNA测序或 mRNA-seq 同样原理，各种类型的转录本都可以用深度测序技术进行高通量定量检测，统称作RNA-seq或RNA测序。目前RNA测序技术主要分为两类，一类是将DNA高通量测序技术应用到由mRNA逆转录生成的cDNA上，从而获得来自不同基因的mRNA片段在特定样本中的含量，各种类型的转录本都可以用深度测序技术进行高通量定量检测。另外一类就是最新的直接测序方法：利用单分子测序技术来进行RNA直接测序。第一类的主要代表是Illumina/Solexa测序技术，Life Technologies公司在这一技术的基础上也开发出了一种单细胞转录组测序技术，可以用于研究细胞从内细胞团发育成胚胎干细胞时的基因表达变化。Illumina/Solexa新测序技术基本原理是边合成测序(sequencing by synthesis，SBS) ，即测序过程是以DNA单链为模板，在生成互补链时，利用带荧光标记的dNTP发出不同颜色的荧光来确定不同的碱基，新加入dNTP的末端被可逆的保护基团封闭，既保证单次反应只能加入一个碱基，又能在该碱基读取完毕后，将保护基团除去，使得下一个反应可继续进行，为了增加荧光强度，使之更易被成像系统所采集，该技术在测序之前还需要对待测片段做桥式扩增(bridge amplif