第四讲 RNA生物合成.pptVIP

第四讲 RNA的生物合成 RNA代谢 一、RNA合成的特征 二、原核生物RNA合成 三、真核生物RNA的合成 四、原核与真核生物mRNA的比较 目录 五、内含子的剪接、编辑、再编码及化学修饰 RNA代谢 除了某些RNA病毒之外，所有RNA分子都来自于DNA。基因组DNA通过一个被称为转录的过程把贮存在双链DNA分子中的遗传信息转换到与模板DNA链相互补的RNA单链上。 mRNA，编码了一个或多个蛋白质序列。 tRNA，把mRNA上的遗传信息变为多肽中的氨基酸信息； rRNA，是合成蛋白质的工厂核糖体中的主要成份。 一、RNA合成的特征 1、RNA的前体是四种核糖核苷三磷酸（rNTP）：ATP、GTP、CTP和UTP。 2、RNA链的生长方向也是从5′?3 ′，核苷三磷酸加到新生链的3 ′端，同时除去一分子焦磷酸而生成磷酸二酯键。 3、转录必需以一条DNA链作为模板，按照碱基互补原则进行转录，因此DNA中的A、G、C、T将被分别转录为U、C、G、A。 有义链（或编码链）：与mRNA序列相同的那条DNA链。反义链（或模板链）：指根据碱基互补配对原则指导RNA合成的DNA链。 4、RNA聚合酶与DNA聚合酶不同， RNA聚合酶能起始一条新链的合成，起始的核苷酸一般是嘌呤核苷三磷酸。 5、转录有一定的起始、终止位点。 转录起始点及有关位置表示方法： 转录起始点是指mRNA开始转录的第一个碱基，此点通常用+1表示，由此与转录方向相一致的下游序列的碱基位置用正值表示；与转录方向相反的上游序列的碱基位置用负值表示。 -30 -20 -10 +1 +10 +20 +30 +40 上游 下游 1. RNApol的结构 表4-1 RNApol的结构 二、原核生物RNA合成 （一） 原核生物RNA聚合酶（RNA polymerase) σ因子不仅增加聚合酶对启动子的亲和力，还降低了它对非专一位点的亲和力。 1. 定义 启动子是一段位于结构基因5′端上游区的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确地结合并具有转录起始的特异性。 启动子的位置，可在+1上游，也可在+1下游（个别）。 （二）启动子（promoter) 2. Promoter的结构 可被RNA全酶保护的区域 -50 ~ +20。 同源性序列： - 10 区、-35区 有同源性；强启动子更保守。 Pribnow box -10区， 100个测定启动子中 T46 T41 T40 T43 G43 N T80 A95 T45 A60 A50 T96 G37 富含A/T。 - 35 区，σ 识别区 T82 T84 G78 A65 C54 A54 图4 – 6 一个典型的启动子含有三个部分，由在-35、-10 和起始原点的共有序列组成。 在原核生物中，－35区与－10区之间的距离大约是16－19bp。 下降突变：如果把Pribnow区从TATAAT变成AATAAT就会大大降低其结构基因的转录水平。 上升突变：即增加区共同序列的同一性。如：乳糖操纵子的启动子中，将其Pribnow区从TATGTT变成TATATT，就会提高启动子的效率。 图4 – 4 启动子的共有序列和RNA聚合酶的结合部位。 1 RNA合成的起始 （1） RNApol全酶识别。 RNApol酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程。聚合酶与启动子结合形成封闭复合物。此时，DNA仍处于双链状态。伴随着DNA构象上的重大变化，封闭复合物变为开放复合物。 （2） pppA或pppG起始。 开放复合物与最初两个NTP相结合并在这两个核苷酸之间形成磷酸二酯键后转变为包括RNA聚合酶、DNA和新生RNA的三元复合物。第一个碱基通常为嘌呤。 通过启动子阶段（合成6-9个核苷酸）。 （3）σ 因子脱落 （三） RNA的酶促合成 图4 – 12 在延伸以前，RNA聚合酶要通过若干步。一个紧密的二聚体复合物被转变成一种开放形式，然后变成三聚体复合物。 RNA-