Wnt-5a基因rs566926多态性和甘肃地区人群非综合征性唇腭裂相关性的研究.pfg.docVIP

兰州大学硕士学位论文  摘  要  目的：探讨甘肃省人群非综合征性唇腭裂（ｎｏｎｓｙｎｄｒｏｍｉｃ  ｃｌｅｆｔ ｌｉｐ ｗｉｔｈ  ｏｒ  ｗｉｔｈｏｕｔ  ｃｌｅｆｔ  ｐａｌａｔｅ，ＮＳＣＬ／Ｐ）－与Ｗｎｔ一５ａ基［］ｒｓ５６６９２６位点单核苷酸多态（ｓｉｎｇｌｅ  ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，ＳＮＰ）的关系。 方法：提取甘肃地区２００例ＮＳＣＬ／Ｐ患者及２００例对照外周血ＤＮＡ，根据Ｗｎｔ．５ａ  基因ｒｓ５６６９２６多态性设计一对引物，应用聚合酶链式反应（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  ｃｈａｉｎ ｒｅａｃｔｉｏｎ，  ＰＣＲ）扩增Ｗｎｔ．５ａ基因ｒｓ５６６９２６片段。采用变性高效液相色谱（ｄｅｎａｔｕｒｉｎｇ ｈｉ曲 ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ ｌｉｑｕｉｄ ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ，ＤＨＰＬＣ）技术，检测Ｗｎｔ 态性，用病例．对照方法进行统计分析，并对２２个杂合子父母及患者采用传递不平衡 检验（ＴＤＴ检验）进行分析。最后对病例组有或无家族史ｗｍ．５ａ基因ｒｓ５６６９２６片段 多态性的关系进行卡方检验。 结果：在病例组中Ｗｎｔ．５ａ基因ｒｓ５６６９２６等位基因频率Ａ为６０．００％，Ｃ等位基因频 率为４０．００％；在对照组中Ａ等位基因频率为７５．７５％，Ｃ等位基因频率为２４．２５％，两组 ｃ等位基因频率经卡方检验有统计学差异（ｆ＝２２．７５３，Ｐ＜０．０５）。杂合子父母及患者做 了传递不平衡检验（＃＝１．５０４，Ｐ＞０．０５）说明本实验中的Ｎｓｃ核心家庭不存在遗 传失衡现象。而有家族史的病例组与无家族史的病例组的Ｗｎｔ．５ａ基因ｒｓ５６６９２６的基 因型频率差异无统计学意义（ｆ＝１．４２２，Ｐ＞０．０５）。 结论：中国甘肃地区人群非综合征型唇腭裂患者Ｗｎｔ．５ａ基因ｒｓ５６６９２６位点具有 多态性，Ｗｎｔ．５ａ基因可能是甘肃地区人群非综合征型唇腭裂的危险因素。有无家族 史患者Ｗｎｔ．５ａ／ｒｓ５６６９２６多态性差异无统计学意义，还有待于扩大样本量进一步加以 验证。 关键词：非综合征性唇腭裂；基因多态性；Ｗｎｔ．５ａ；疾病易感性；变性高效液相色 谱；传递不平衡检验 兰州大学硕士学位论文 Ａｂｓｔｒａｃｔ  ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ：Ｔｏ  ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅ ｔｈｅ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｎｏｎｓｙｎｄｒｏｍｉｃ ｃｌｅｆｔ ｌｉｐ ｗｉｔｈ  ｏｒ  ｗｉｔｈｏｕｔ ｃｌｅｆｔ  ｐａｌａｔｅ（ＮＳＣＬ／Ｐ）ａｎｄ  ｇｅｎｅｔｉｃ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ ｏｆ Ｗｎｔ一５ａ／ｒｓ５６６９２６ ｉｎ  Ｇａｎｓｕ  ｐｒｏｖｉｎｃｅ ｏｆ Ｃｈｉｎａ．  Ｍｅｔｈｏｄｓ：Ｇｅｎｏｍｉｃ  ＤＮＡ ｗａｓ ｉｓｏｌａｔｅｄ ｆｒｏｍ ｐｅｒｉｐｈｅｒａｌ ｌｙｍｐｈｏｃｙｔｅｓ ｏｆ ２００ ｐａｔｉｅｎｔｓ  ｗｉｔｈ ＮＳＣＬ／Ｐ ａｎｄ ２００ ｎｏｒｍａｌ ｍａｔｃｈ ｃｏｎｔｒｏｌｓ．Ａｃｃｏｒｄｉｎｇ  ｔｏ  Ｗｎｔ－５ａ／ｒｓ５６６９２６  ｇｅｎｅ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ｄｅｓｉｇｎ  ａ  ｐｒｉｍｅｒ，Ｗｎｔ  ｇｅｎｏｔｙｐｅｓ ｗｅｒｅ  ｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ ｂｙ  ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｃｈａｉｎ  ｒｅａｃｔｉｏｎ（ＰＣＲ）．Ｗｎｔ一５ａ／ｒｓ５６６９２６ ｖａｒｉａｎｔ  ｗａｓ  ｄｅｔｅｃｔｅｄ  ｂｙ  ＤＨＰＬＣ．Ｗｅ  ｐｅｒｆｏｒｍｅｄ  ｔｈｅ  ｃａｓｅ－ｃｏｎｔｒｏｌ ａｎａｌｙｓｉｓ  ａｎｄ  ｕｓｅｄ ｔｒａｎｓｍｉｔｔｅｄ ｄｉｓｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ ｔｅｓｔ（ＴＤＴ）ｔｏ  ｃａｌｃｕｌａｔｅ ２２  ｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｕｓ ｐａｒｅｎｔｓ ｗｉｔｈ  ａｎ ａｆｆｅｃｔｅｄ  ｃｈｉｌｄ．Ｔｈｅ ｖａｒｉａｎｔｓ ｉｎ ｔｈｅ ＮＳＣＬ／Ｐ  ｐａｔｉｅｎｔｓ ｗｉｔｈ  ａｎｄ ｗｉｔｈｏｕｔ ｆａｍｉｌｙ  ｈｉｓｔｏｒｙ ｗｅｒｅ  ｅｘａｍｉｎｅｄ  ｂｙ ｚ２ ａｎａｌｙｓｉｓ．  Ｒｅｓｕｌｔｓ：Ｉｎ  ｃａｓｅ－ｃｏｎｔｒｏｌ ａｎａｌｙｓｉｓ，ｔｈｅｒｅ ｗｅｒｅ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓ  ｉｎ Ｃ ａｌｌｅｌｅ  ｇｅｎｏｔｙｐｅ  ｏｆ  Ｗｎｔ一５ａ／Ｂ５６６９２６  ａｍｏｎｇ  ＮＳＣＬ／Ｐ  ｃｏｍｐａｒｅｄ  ｗｉｔｈ  ｔｈｅ  ｃｏｎｔｒｏｌ  ｇｒｏｕｐ  （Ｘ２＝２２．７５３，Ｐ＜０