尹礼国第4章核酸化学[2015年10月12日]答题.ppt

基因组学 基因组学[1]? （英文genomics），研究生物基因组和如何利用基因的一门学问。用于概括涉及基因作图、测序和整个基因组功能分析的遗传学分支。该学科提供基因组信息以及相关数据系统利用，试图解决生物，医学，和工业领域的重大问题。 基因组研究应该包括两方面的内容： 以全基因组测序为目标的结构基因组学（structural genomics） 以基因功能鉴定为目标的功能基因组学（functional genomics ，又被称为后基因组（postgenome）研究，成为系统生物学的重要方法。 真核细胞染色质DNA的一级结构特点 真核细胞染色质DNA具有许多重复排列的核苷酸序列 在真核细胞中，除组蛋白外，其它所有蛋白质都由DNA中单一序列决定的，这种序列的大小不等，每一段顺序决定一个蛋白质结构，为一个蛋白基因，称为结构基因 在DNA分子中，除了编码蛋白质和RNA的一些段落外，还有一些段落不编码任何蛋白质和RNA，可以存在于基因与基因之间，也可出现在基因内，前者称为间隔顺序，后者为插入顺序。通常将插入的顺序称为内含子，把编码部分称为外显子。 回文结构 二、DNA的二级结构 （一）Chargaff定则： DNA碱基组成具有生物种的特异性；无组织/器官特异性； 不受生长发育、营养状况及环境条件的影响。 （二）DNA二级结构的多态性 Watson-Crick双螺旋结构模型 左旋DNA-Rich模型 三链DNA 四链DNA DNA双螺旋结构的研究背景和历史意义 碱基组成分析 Chargaff 规则：[A] [T] [G] ? [C] 碱基的理化数据分析 A-T、G-C以氢键配对较合理 DNA纤维的X-线衍射图谱分析 ★ 3.2.1 DNA双螺旋结构的研究背景和历史意义 碱基组成分析 Chargaff 规则：[A] [T] [G] ? [C] 碱基的理化数据分析 A-T、G-C以氢键配对较合理 DNA纤维的X-线衍射图谱分析 DNA双螺旋结构发现的历史意义： 揭示了生物体遗传信息储存及表达的分子机制 开创了现代分子生物学 生物学发展史上的里程碑 3.2.2 DNA双螺旋结构模型要点 （Watson, Crick, 1953） DNA分子由两条相互平行但走向相反的脱氧多核苷酸链组成，以右手螺旋方式绕同一公共轴盘。 形成大沟 major groove 及小沟 minor groove 相间。 嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧; 磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧，彼此以3’,5’-磷酸二酯键连接，形成DNA分子的骨架。 碱基环平面与螺旋轴垂直，糖基环平面与碱基环平面成90°角。 3.2.2 DNA双螺旋结构模型要点 （Watson, Crick, 1953） DNA双螺旋结构模型要点 （Watson, Crick, 1953） 螺旋直径为2nm，相邻碱基平面距离0.34nm，螺旋一圈螺距3.4nm，一圈10对碱基。 碱基垂直螺旋轴居双螺旋内側，与对側碱基形成氢键配对（互补配对形式：A T; G?C） 。 碱基互补配对 T A G C DNA双螺旋结构模型要点 （Watson, Crick, 1953） 氢键维持双链横向稳定性 碱基堆积力维持双链纵向稳定性。 离子键屏蔽磷酸基团之间的静电斥力 DNA双螺旋结构的多样性 天然DNA在不同的湿度、不同盐溶液中的DNA构象不同 DNA双螺旋通过扭曲和折叠所形成的特定构象。 包括： 不同二级结构单元间的相互作用 单链与二级结构单元间的相互作用 DNA的拓扑特征 超螺旋是DNA三级结构的主要形式。 （三）DNA的三级结构 三、DNA的三级结构 DNA双 超螺旋结构 真核细胞染色质的组装 原核生物和真核生物基因组比较 原核生物基因组特点 重复序列少，多为编码区 多为操纵子形式组织 有重叠基因存在 真核生物基因组特点 重复序列多，大量序列不编码蛋白质（即间隔序列） 不连续基因由内含子与外显子交替排列组成 以染色体存在 第四节 核酸及核苷酸的性质 一、溶解性 DNA白色纤维状固体，RNA白色粉末状固体，都微溶于水，不溶于一般有机试剂（乙醇沉淀核酸），钠盐易溶于水。 DNA、RNA在生物细胞内大都与蛋白质结合成核蛋白 DNA蛋白的溶解度在低浓度盐溶液中随盐浓度的增加而增加，在1mol/L NaCl溶液中溶解度比纯水高2倍，可是在0.14mol/L 的NaCl溶液中溶解度最低，仅为水的1%，几乎不溶解。 RNA蛋白在盐溶液中的溶解度受盐浓度影响较小，在0.14mol/L 的NaCl溶液中的溶解度较大。 DNA蛋白、RNA蛋白在不同pH中的溶解度不同 二、核酸及其组分的两性性质 核酸和核苷酸具有磷酸基，因而呈酸性，同时有含氮碱基，具有碱性，为两性电解质 核酸分子的多核