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第五章 酶学 酶(enzyme,E):是由活细胞产生的具有催化作用的特殊物质,又称生物催化剂。 除极个别RNA为催化自身反应的酶外,其余所有的酶都是蛋白质。 生物体内一切生化反应都需要酶的催化才能进行! 性能远远超过人造催化剂。 产物(product,P)、底物( substrate,S ) 第一节 酶促反应特点及酶的分类 第二节 酶的结构与功能的关系 第三节 酶作用的机制 第四节 酶促反应的动力学 第五节 影响酶作用的因素 第六节 酶活力的测定 第七节 酶的多样性 一、 酶的催化特性 催化剂的共性是什么? 答:①机理:降低反应活化能,提高反应 速度,不改变平衡点 ②只起催化作用,本身不消耗; (一)催化效率高 (二)高度的特异性(专一性) (三)酶催化反应的条件温和 (四)酶的催化活力可被调节控制 (一) 高效性 反应速度比无酶催化的反应高108~1020倍,比一般催化剂催化的反应高106~1013倍。 (三)酶催化反应的条件温和 常温、常压、中性 (四)酶的催化活力可被调节控制 提问:如果没有活力调节会怎样? 浪费(物、能)、产废 二、 酶的命名 三、 酶的分类 一)根据催化的反应类型分(大体分六大类) a.氧化还原酶(oxidoreductases) 1.脱氢酶 A—H2 + B(辅酶 )←→ A + B—H2 2.氧化酶 B—H2 + 1/2 O2 ←→ B + H2O b.转移酶(transferases) A—X + B ←→ A + B—X 二)根据酶分子结构的特点和大小分: 单体酶、寡聚酶、多酶体系 提问:通过望文生义说说这些酶的区别? 酶由一条肽链组成 酶为寡聚蛋白 几个独立的酶组合起来形成络合体,催化一个系列反应(第九章 糖代谢、第十一章脂代谢中) 三、按酶分子组成的不同分 单纯酶与结合酶(见第二节) 四、 酶的系统编号 核糖核酸酶T1 EC 3 . 1 . 4 . 8 第二节 酶的结构与功能的关系 一、酶的分子组成 一)、单纯酶(simple enzyme) 蛋白酶、淀粉酶、酯酶、核糖核酸酶 二)、结合酶 (conjugated enzyme): 全酶 = 酶蛋白 + 辅因子 holoenzyme apoenzyme cofactors 1、 酶蛋白(apoenzyme) 决定酶催化反应特异性的作用 2、辅因子(cofactors) 辅因子决定酶催化反应的性质或类型 弥补氨基酸基团催化强度的不足: 使肽键失稳 2. 协助活性中心基团快速转移(进出) 酶的催化作用依赖于全酶的完整性 二、酶的活性中心 常见的酶活性中心的必需基团 主要包括: 亲核性基团: 丝氨酸的羟基 半胱氨酸的巯基 组氨酸的咪唑基。 常见的酶活性中心的必需基团 必需基团可分为: 接触残基(contact residue) 辅助残基(auxiliary residue) 结构残基(structure residue) 非贡献残基(noncontribution residue) (二)酶的活性中心(active center): 酶活性中心和必需基团 活性中心包括: 1.结合中心 Binding center 酶分子中与底物结合的部位或区域一般称为结合中心。 2.催化中心 catalytic center 酶分子中促使底物发生化学变化的部位称为催化中心。 通常将酶的结合部位和催化部位总称为酶的活性部位或活性中心。 结合中心决定酶的专一性,催化中心决定酶所催化反应的性质。 (三)酶活性中心必需基团的鉴定 1、共价修饰法 选用适当的化学试剂与酶蛋白中的氨基酸残基的侧链基团发生反应引起共价结合、氧化或还原等修饰,称之为化学修饰。酶分子中可以修饰的基团有:-SH、-OH、咪唑基、氨基、羧基、胍基等,用作修饰的试剂很多,目前已有七十多种,但专一性的修饰剂不多。 2、亲和标记法: 如胰凝乳蛋白酶最适底物为:N-对甲苯磺酰-L-苯丙氨酰乙酯或甲酯,根据此结构设计的亲和标记试剂为:N-对甲苯磺酰-苯丙氨酰氯甲基酮(TPCK)。其分子中的氯甲基酮部分可使酶的His57烷基化形成酶-TPCK衍生物而使酶失活。 (四)酶的活性中心的一级结构 从上表可知,一些丝氨酸蛋白酶在活性丝氨酸附近的氨基酸几乎完全一样,而且这个活性丝氨酸最邻近的5-6氨基酸顺序,从微生物到哺乳动物都一样,说明蛋白质活性中心在种系进化上有严格的保守性。 三、酶的活性与高级结构的关系
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