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山羊皮肤组织SCF基因的克隆与序列分析 　　摘要：对山羊SCF基因的结构与序列进行了分析，参考山羊和绵羊SCF基因序列设计引物，利用PCR克隆获得了山羊SCF基因的两个剪接体序列，同时对其进行了生物信息学分析。结果表明，山羊SCF基因分泌型和跨膜型编码区长度分别为825 bp和741 bp，长度差异主要是由外显子6缺失/插入引起的，与绵羊和牛的同源性分别为98%和97%。13个物种的SCF基因的系统发育聚类与动物分类学基本一致。 　　关键词：山羊；SCF基因；分泌型；跨膜型 　　中图分类号：S827；Q785 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2014）02-0450-03 　　Cloning and Sequence Analysis of SCF Gene in Goat Skin Tissue 　　ZHANG Jun-jie1，XI Jian-zhong1，ZHOU Rong-yan1，2，LI Xiang-long1，2，LI Lan-hui1，CHEN Hui1， 　　ZHANG Zhen-hong1，ZHAO Zhu-jun1，2 　　（1.College of Animal Science and Technology， Agricultural University of Hebei， Baoding 071001， Hebei， China；2.Embryo Engineering and Technological Centre of Cattle and Sheep of Hebei Province， Baoding 071001， Hebei， China） 　　Abstract： To investigate the structure and sequence of SCF gene in goat， primers were designed based on the sequence of goat and sheep. Two transcript splices were obtained with PCR and cloning and bioinformatics analysis of the sequence was made. The results showed that the length of coding sequence of soluble and transmembrane SCF gene in goat is 825 bp and 741 bp， respectively. The length difference was due to the deletion/insertion of 6th exon. The identity of SCF gene between goat and sheep or cattle was 98% and 97%， respectively. The phylogenetic clusters based on SCF gene sequence of thirteen species were the same as the zootaxy. 　　Key words： goat； SCF gene； soluble type； transmembrane type 　　哺乳动物毛色是由体内黑色素决定的，黑色素包括真黑素（Eumelanin）和褐黑素（Phenomelanin）。真黑素使毛发表现为褐色和黑色，褐黑素使毛发表现为黄色和红色，两种色素分布与比例的不同表现为哺乳动物不同的毛色类型。黑色素存在于黑素细胞的黑素体中，这些黑素体在被毛的生长过程中通过胞吐作用转移至被毛，黑素细胞的增殖与分化是黑色素产生的关键。 　　皮肤中的干细胞因子（Stem cell factor，SCF），也称为kit配体或青灰因子，主要来源于角质形成细胞，由于转录过程中存在着差异，干细胞因子在体内以分泌型（s-SCF）和跨膜型（tm-SCF）两种形式存在，通过其受体c-kit介导细胞的增殖、分化等生物学功能。SCF/c-kit信号通路在调节黑素细胞的存活、分化、移行和增殖等过程中起重要作用[1]。在哺乳动物中毛色是绒、毛、羔皮及裘皮用山羊的重要经济性状，也是识别个体、血液系统和品种归属的遗传标志之一。因此，本研究克隆了山羊皮肤组织中的SCF基因序列，同时进行了结构分析，并基于测定序列构建了进化树，为进一步研究SCF基因在毛色形成中的功能奠定了基础。 　　1 材料与方法 　　1.1 材料 　　EasyPure RNA Kit、pEASY-T3 Cloning Kit和感受态细胞Trans1-T1购