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在重组的世界中发现新希望
論文報告與寫作--科普習作
Combinatorial Biosynthesis Yields Novel Analogs of Natural Products
Hugo G. Menzella and Christopher D. Reeves
參考資料寫法不對
基本內容通順,除了部分對英文的誤解外
但是本文要寫成科普有著太多的化學式,改寫更要細心
背景資料
生物體中代謝反應如果是一條生產線,那麼酵素就是一個個的作業員,雖然只負責其中的一個小工作,但是若要得到終產物則必須倚賴所有參與的酵素,而且缺一不可。現今,我們希望藉由重組基因工程,調整代謝反應中的酵素,使其能繼續保有功能外,也能讓生物自然生產類似的天然產物。但是利用重組基因工程來操縱微生物之代謝反應,生產類似的天然產物,要比利用一般化學方法製造更為困難。但是利用這種方式,除了可以降低生產成本外,也可以大量生產化學異構物來幫助新藥的發現。但是要實現這方法,卻要克服一些障礙,許多研究人員以及相關的生物科技產業,都還在努力。類似的產物polyketide synthase (PKS)或是nonribosomal peptide synthetase (NRPS)此酵素在生產線上的機制需要兩種抗癌藥劑的幫助,抗癌藥劑分別是epothilones C和epothilones D。其中包含了一些帶有acyl carrier protein (ACP)的PKS及一個帶有peptidyl carrier protein (PCP)的NRPS不論是ACP還是NRPS都具有phosphopantetheine (PP)圖中指出了一些會起催化反應的區域。在PKS中,像是ketoacyl synthase
(KS)、acyltransferase (AT)、ketoreductase (KR)、acyl carrier protein (ACP)、dehydratase (DH)、enoyl reductase (ER)、methyltransferase (MT)以及thioesterase (TE)。而在NRPS中,形成thiazole環的 condensation (C)、adenylation (A)、peptidyl carrier protein (PCP)、and oxidation (Ox)等,都是發生催化反應的區域。這些區域通常是一條伸長且連續的胺基酸序列。epothilones C和epothilones DStreptomyces fradiae(弗氏鏈黴菌)去合成新的抗生素(hybrid 16-membered macrolide)。藉由原始種的tylactone (圖中紅色基因)去產生tylosin,而原本應該存在於PKS的基因—tylactone則被取代,也就是chalcolactone PKS的前兩個基因(圖中藍色基因)與platenolide PKS的後三個基因(圖中橘色基因)。
此外,methoxymalonyl-ACP的基因需要由SrmGIV來表現。我們發現基因TylH不能使hybrid macrolide形成,而是由另一基因ChmH來表現,讓我們得到理想產物。
( 圖二
建立基因庫有助於重新組裝組件
在Escerichia coli()中,經由重組基因而得新的PKS。DNA cassettes(經過設計的一段DNA,可以確定基因起始位置)編碼出變異的區域,以及幾個由獨特的氨基酸序列去取代後,可以構成PKS的組件,如圖中A所示。圖中B提供了一整套的組件,可以簡易的被組裝成具有功能的一個完整單位。被組裝的組件要能表現在相容的質體上。圖中C所示,供给能量的組件是由propionyl unit—Microbe,由其中features專欄所刊登
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