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关联分析及其在不同分子标记中的应用 摘要：关联分析技术在植物中的应用较晚，是近些年才在植物数量性状和植物遗传育种研究中得以应用。关联分析以LD为基础，用来鉴定植物性状与目标基因之间的关系。关联分析有很明显的应用优势，它不仅不需要特殊的构图群体，而且还能够同时对多个基因位点进行检测，精度非常高。由于其良好的实用性，关联分析技术已成为国际基因组学的研究热点。本文介绍了LD定义和度量方法，综述了基于分子标记的关联分析在植物遗传上的应用，并对其在遗传学中的应用和发展作了展望。 关键词：分子标记；关联分析；连锁不平衡 Association analysis and its application in different molecular markers Abstract: Association?analysis?as?an?analytical?method?has?been?widely?applied?in?quantitative?traits?and?plant?breeding?research?recently,?whi-ch?is?based?on?linkage?disequilibrium.?It?is?a?method?in?order?to?identify?the?relationship?between?character?and?genetic?markers? or?candidate?genes?within?a?group.??Association analysis has obvious application advantages, not only does it don’t need spe-cial composition group, but also can simultaneously to test the multiple loci, the accuracy is very high. Due to its good practicability, association analysis has become the international genomics research hotspot.This?paper?describes?the?definition-n?and?measurement?methods?of?linkage?disequilibrium,?summarized?the??application?of?correlation?analysis?in?plant?molecular?marke-rs.?And?we?made?prospects?for?its?future?development?and?application?in?plant?genetics?. Key words: Molecular marker ; Association?analysis; Linkage disequilibrium 关联分析，又称连锁不平衡作图（LD mapping），是建立在连锁不平衡的基础上，用于鉴定群体内目标性状与遗传标记相关关系的方法[1]。关联分析最早人类疾病的研究，并取得了丰硕的成果。目前,在人类不同致病基因方面已有许多成功的报道[2]。在动物中的应用中也相对较多，如奶牛、鱼、羊、猪、鸡等。然而在植物中的应用相对较少[3]。但是，随着生物信息学、统计学和基因组学技术的快速发展，关联分析也已成功的应用到许多植物上，如玉米、小麦、拟南芥、大麦、大豆等。近年来，许多植物的全基因组测序完成，这极大的促进了基因组学的发展，特别是近年来大量SNP（single nucleotide polymorphisms）标记的开发，关联分析植物关键基因的发掘，为植物分子育种提供标记，这在国际上已经成为热点研究方向。 关联分析通过群体上的进化历史和重组，可以在序列水平上来研究复杂的数量性状，因此，与其它分析手段相比，关联分析，（1）所需时间短,用自然群体作为材料,不需要专门构建，且，相对于QTL至少需两年以上的群体能节约大量的时间；（2）检测范围大,同一座位的不同基因可以用来同时检测，而QTL作图只能检测来自双亲的两个等基因；（3）准确精准, QTL作图精度一般在10～30cM左右，很少能在基因水平上被标记，而关联分析可达到单基因的水平[4-5]，如Gebhardt等[6]利用关联分析方法将马铃薯抗晚瘟病基因RI定位在0.2cM的基因组区段内。，由于，因此，关联分析在植物中的应用比动物中吸引力更高。 基金项目：国家自然科学基金项目（座机电话号码） 作者简介：韩俊杰 1989- ，男，硕士。主要从事小麦品质遗传改良研究。E-mail: hanjunji