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第13章 蛋白质合成
Genetic information-DNA and Central dogma (Replication, Transcription and Translation) pr的生物合成需要信息、能量、物质: ◆ mRNA, rRNA and tRNA ◆ Energy-ATP, GTP ◆ Material-Aa (Activated RNAAa) ◆ Cofactors-E、Protein factors、Metal ions Genetic code [遗传密码]: 指DNA分子中特定的Nt Sequence指定特定的Aa Sequence ,这种相关关系或“翻译语言”称为… Codon[密码子]: 每3个Nt 顺序指令一个Aa的排列位置,这3个相邻的Nt 称“三联体[Triplet]”或“密码子”。 一、Evidence of Genetic code 1、Mathematics Evidence 50年代,人们已经知道pr的Aa顺序与Nt顺序有关,但Nt 4种,Aa 20种,4种 Nt 怎样编排才能有效地指导Aa顺序呢?人们首先在数学上加以推导(择要介绍) 1个Nt决定1个Aa, 41 = 4 不能满足指导20Aa的需要 2个 42=16 仍不能 3个 43=64 最可能 4个 44=256 太多 2、Biochemical Evidence 1)Poly U(人工mRNA),20种Aa,在E.Coli-无细胞系中保温,获得Single Phe Peptide(Phe 密码为UUU) Poly A做模板时,获得单一Lys肽链(Lys密码为AAA) Poly C 做模板时,获得单一Pro肽链(Pro密码为CCC) 四联体 UGUG UGUG UGUG…or GUGU GUGU… 为模板获得单一Aa链(UGU为CySH、GUG为Val)结果:N-CySH-Val-CySH-Val-CySH-Val-C。证明确以三联体密码(Triplet condon)形式存在。 同样方法证明了其它Aa的三联体密码。 2)E.Coli Ribosome +Templet of Chemical Synthesis (人工模板) + 相应Aa-tRNA+Mg2+保温。 a. Do not add GTP Add GTP b. 模板改为5′PGUUGUU-OH 3′ Val结合于模板 c. 模板改为5′PGUU-OH 3′ Val结合于模板 d. 模板改为5′P-GU-OH 3′无Val结合于模板(至少需要三Nt) f. 模板改为5′-OH-GUU-P-3′无Val结合于模板 说明:只有5′P才具模板功能,即翻译有方向性 5′? 3′;需GTP 根据以上大量实验,65年编遗传密码字典。其中AUG 为起始信号,UAA,UAG,UGA为终止Codon 二、Characteristics of Genetic Code 1、Commaless(无标点) From AUG→???? to UAA,一个接一个阅读,其间无 Nt 隔开。插入或删去一个Nt, 即造成移码突变,如: …UGU GUG UGU GUG… Cys Val Cys Val …UGU GGU GUG UGU… Cys Gly Val Cys 2、Currency(通用性,近乎) Virus、Procaryote、Eucaryote…都用同一套Genetic Code,如用兔红血球核糖体(含mRNA)与E.Coli tRNA 及pr合成其它因子保温,合成了兔Hb,说明E.Coli tRNA能正确阅读兔Hb的mRNA上的信息。 但同一Aa的几组Codons,不同生物利用频率不同 3、 Degeneracy(简并性) 大多数Aa, 除Met, Trp外,都可具有好几组Codon, (64:20)。如UGU,UGC皆为Cys,几种密码子编码同一Aa的Codon叫简并Codon(同义密码子) 4、第三碱基的变偶性(Wobble)(第三碱基具较低专一性) Codon的专一性主要由头两个N决定,第三碱基不那么重要,这一性质称Codon的变
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