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分子遗传学2014
简答题:
核小体与核小体定位在基因表达及其调控中有何作用?
核小体是染色质的基本结构单位,体内外试验均证实,核小体是基因转录的通用抑制子。细胞内基因组包裹在核小体内,如果启动子区在核小体内,则转录通常会被抑制。试验也证明由于缺少H4组蛋白,在核小体不能形成的酵母细胞系中,很多基因变成组成型表达,而在正常的细胞中,他们均处于抑制状态。
核小体在DNA中的精确定位对细胞正常功能的发挥起重要作用。由于核小体与DNA的动态相互作用,大多数核小体的位置是不固定的。但是在有些情况下,某些核小体被限定在基因组的固定位置上,或者说DNA序列仅以一种特定的构型装配成核小体,则DNA上的每个位点将一直位于核小体上的特定位置,我们称这种装配类型为核小体定位。
核小体的定位对基因的表达调控有重要的影响。它的定位变化总是伴随着基因从抑制到转录状态的转变。核小体的定位或定位的去稳定或解除可能是影响基因转录调控的重要因素。大量的试验结果表明,核小体的形成和在染色质的精确定位是真核基因表达所必需的。
有人提出核小体的形成及其在染色质上的精确定位有以下两方面的作用:(1)提供一个支架结构,使转录因子之间的信息传递更有效;(2)染色质结构的不均一性,即某些区域不形成核小体,保证了转录因子易于接近染色质模板。
常见的反式作用因子有哪些?其结构特点是什么?
这些调节着基因转录活性的反式作用因子,通称为转录因子,已鉴别的转录因子可分为普遍性和组织特异性两类。转录因子有数千种之多,从其结构特点来看,主要有两大功能区,①DNA结合域,②活性域。对于DNA结合域,根据其氨基酸结构域的特点,又可分为:螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix,HTH),锌指(zinc finger),螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix,HLH),亮氨酸拉链(leucine zipper,ZIP),同源异型域(homeodomain,HD),激素受体类(类固醇等)或核受体类,β桶(β-barrels)结构等。
锌指蛋白(zinc finger protein)是由含有锌指结构域的两类蛋白质组成,即传统的锌指蛋白和类固醇受体结合蛋白质。锌指结构域是由蛋白质上保守的半胱氨酸及/或组氨酸与锌原子结合形成一个手指状的结构。典型的锌指蛋白往往有多个锌指结构域,其保守序列为Cys-X2-Cys-X3-phe-X5-leu-X2-His-X2-His,锌原子与其中两个半胱氨酸和2个组氨酸结合形成四面体结构,长23个氨基酸,两个锌指之间由7(8个氨基酸相连。从每个锌指的三级结构来看,其N端形成β折叠,C端形成α螺旋。反向平行的β折叠区含有2个半胱氨酸,与其后α螺旋中的2个组氨酸一起与锌原子结合,而由锌原子稳定了整个锌指结构。
同源异型域蛋白属于HTH蛋白,可形成三个螺旋区,其中螺旋2、螺旋3形成典型的HTH域,螺旋3识别螺旋与DNA大沟结合,其N末端臂参与DNA小沟的结合,同源异型域蛋白形成二聚体后才与DNA结合
β-桶(β-barrels)结构,每个亚基上的α-螺旋则与DNA大沟相结合,两个相邻的大沟被识别螺旋结合后可导致DNA分子发生45°的弯曲。
HLH长40~50个氨基酸,由两个长15~16个氨基酸的亲水,亲脂的α螺旋及长度不同的环(连接区)将其分开。两蛋白的两个α-螺旋疏水面相互作用可形成同二聚体或异二聚体,多数HLH附近有一强碱性的氨基酸区,但也有不含该区的HLH,含有碱性区的HLH称为bHLH或HLP,是DNA的识别和结合所必需的,但与DNA结合能力的差异则是由bHLH基序及二聚体的状况所控制的。
亮氨酸拉链(leucine zipper,ZIP)的双亲α螺旋其疏水面亮氨酸突出,并与另一个平行的亮氨酸拉链蛋白的亮氨酸突出交错排列,盘绕成卷,两个右手螺旋互相缠绕,每圈3.5个氨基酸,每7个残基构成一个完整的重复单位,因此亮氨酸在拉链区每隔6个氨基酸残基重复出现一次,两个蛋白形成同源二聚体或异源二聚体。在每个拉链蛋白质中与亮氨酸重复序列邻近的区域是高度碱性的,可作为一个DNA的结合位点。整个二聚体呈Y型结构,拉链构成茎,两个碱性区分叉形成臂,横跨在DNA分子上并与相邻的DNA两个大沟结合,这称为bZIP。
原核生物与真核生物基因表达调节机制的主要差别是什么?
原核生物和真核生物基因表达调控的不同
在原核生物中,基因表达的调控以转录水平调控为主,在调节基因的作用下,主要以操纵子为单位,转录出一条多顺反子mRNA,并指导蛋白质合成;而且转录和翻译是偶联的,很少发生mRNA的加工、修饰。但也存在转录后水平的调控,例如反义RNA的调控,翻译的调控,RNA开关等。
在真核生物中,基因表达的调控十分复杂,可发生在多个层次、多个水平,包括从染色体和染色质的表观遗传学控制
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