流程大放送-CGH芯片分析流程.docVIP

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2017-06-08 发布于重庆
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流程大放送-CGH芯片分析流程

#流程大放送#aCGH芯片数据整合表达芯片数据分析流程背景介绍拷贝数变异（Copy Number Variation, CNV）是基因组除寡核苷酸多态性（SNP）外一种常见的变异，是因染色体重排导致的基因组1kb以上的变异。越来越多的研究表明，CNV在疾病发生发展过程中起着重要的作用。 aCGH 芯片技术是检测基因组拷贝数变异的一种高效且经济的方法。目前市场上有多种aCGH芯片商，但是原理都相同，都是采用双色探针杂交技术，即case基因组和control基因组用不同颜色标记，通过计算log2（case/control）ratio计算拷贝数。将基因组和转录做整合分析，从基因组异常寻找转录组异常的原因，从转录异常体现基因异常的结果。目前已有许多将两种组学数据整合分析的尝试，如通过整合寻找基因关键的突变，结合网络分析，疾病亚型分析等等。分析流程： 2. CNV的DEL和DUP的不同染色体分布： 3. CNV分布的circos图 ____________________________________________________________