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- 2016-11-06 发布于天津
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instituteofbotany,thechineseacademyofsciences作图函数
(3)生态位的阐述: 物种是按单峰曲线沿生境梯度分布的, 物种在排序空间的分布表明物种和环境的关系,物种和样方的相对位置表明物种和样方的相对关系。 如图中,22号样方和青冈(CYCGLA) B. 只在少数样方出现的物种通常在排序空间的边缘,表明它们只偶然发生,或它们只在稀有生境(如米槠CASCAR)。 C. 在排序空间中心的物种,可能在取样区域是该物种最优分布区,如甜槠,或有两个或多个最优分布区,或与前两个轴不相关。 除趋势对应分析(Detrended correspondence analysis, DCA): CA采用单峰曲线表示物种和环境关系 CA产生的弓形效应 CA的第二排序轴在许多情况下是第一轴的二次变形,即所谓的“弓形效应”(Arch effect)或者“马蹄形效应”(horse-shoe effect)。 DCA在R中的实现采用函数decorana。 decorana(veg, iweigh=0, iresc=4, ira=0, mk=26, short=0, before=NULL, after=NULL) veg:群落数据; iweig:稀有物种的权重; iresc:纠正弓形效应的次数; ira:分析的类型(0: DCA, 1:CA); mk:校正弓形效应轴的分段数; short: 需要校正的最短梯度。 plot(decorana(gtsdata))
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