教育文件生物信息学陈润生.ppt

大规模基因功能表达谱的分析 随着人类基因组测序逐渐接近完成，人们自然会提出如下的问题：即使我们已经获得了人的完整基因图谱，那我们对人的生命活动能说明到什么程度呢？人们进一步提出了一系列由上述数据所不能说明的问题，例如：基因表达的产物是否出现与何时出现；基因表达产物的定量程度是多少；是否存在翻译后的修饰过程，若存在是如何修饰的；基因敲除（knock-out）或基因过度表达的影响是什么；多基因差异表达与表现型关系如何等等。概括这些问题，其实质应该是：知道了核酸序列和基因，我们依然不知道它们是如何发挥功能的，或者说它们是如何按照特定的时间、空间进行基因表达的，表达量有多少。 microarrays Affymetrix Oligos Don’t have to know sequence Glass slides Pat brown 功能图谱 后基因组研究对象的多层次 遗传图谱（Genetic map） 限制性图谱（Restriction map） 物理图谱（Physical map） 功能图谱（Functional maps） 研究思路的变化 更好整合生物过程不同阶段的分散数据. 基因组 + 转录组+ 蛋白质组 + 代谢组 满足复杂查询的整合数据库. 对复杂生物过程的更好模拟. 蛋白质折叠. 复杂系统建模. Signaling/Metabolic pathwa