基于q-tof的代谢组学分析在青枯菌致病性研究中的应用.docVIP

基于LC/Q-TOF MS代谢组学芽胞杆菌分类方法研究 史怀，刘波*，陈峥，刘国红，潘志针，陈梅春 福建省农业科学院农业生物资源研究所 摘要：建立了基于LC/Q-TOF MS的代谢组学方法，对不同种的芽胞杆菌进行分析，获得了具有显著差异性的潜在生物标记物，并采用分层聚类和PCA数据处理方法对各芽胞杆菌进行分类，建立PLSDA预测模型。结果表明，不同的芽胞杆菌种间具有显著性差异，该方法可从代谢水平上对芽胞杆菌种属进行分类，为芽胞杆菌的分类提供了一种新的技术手段。 关键词：芽胞杆菌，代谢组学，分类方法 芽胞杆菌是一类好氧或兼性厌氧的杆菌或球菌，能产生具有对热、干燥、辐射、某些化学药品以及其他理化因素具有较强抵抗力的芽孢，因此可忍受多种不良环境[1]，广泛存在于土壤、水、空气以及动物肠道等处，与人类关系密切。目前已知的芽胞杆菌约有244个种[2]，其中很多芽胞杆菌菌株都具有特殊功能，在工业、农业、医药、食品甚至军事等诸多方面具有广泛的应用价值，其分类学研究具有极其重要的意义。 芽胞杆菌的分类鉴定方法有经典分类、分子生物学分类、化学分类、数值分类以及多相分类等，这些方法各有其优缺点。代谢组学（metabonomics）是一门对某一生物或细胞所有低相对分子质量代谢产物进行定性和定量分析的学科[3]，具有中体动态、无偏向性、研究技术多样、实验方法灵活等特点。与传统依赖单一标志物的