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第1章 蛋白质的结构与功能
一、蛋白质的分子组成
1、组成蛋白质的元素:主要有C、H、O、N和 S各种蛋白质的含氮量平均为16%
2、组成单位:氨基酸 有20种
3、等电点:在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点.
pH=pI pH pI pH
兼性(中性)离子 阳离子 阴离子
?
4、肽:氨基酸通过肽键连接形成.多肽链:是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。
多肽链有两端: N 末端 C 末端
氨基端 羧基端
二、蛋白质的分子结构
1、 Pr的一级结构:指在蛋白质分子从N-端至C-端的氨基酸排列顺序。
主要的化学键:肽键,有些Pr还包括二硫键。
2、Pr的二级结构:多肽链主链骨架原子的相对空间位置。
主要的化学键:氢键 。
形成二级结构的基础:肽单元
a-螺旋b-折叠b-转角无规卷曲
3、 Pr的三级结构 :整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。
主要的化学键:疏水键、离子键(盐键)、氢键和 Van der Waals力(范德华力)等
4
亚基之间的结合主要是:氢键和离子键
三、蛋白质结构与功能的关系
蛋白质的变性:特定的空间构象被破坏
变性的结果
理化性质改变和生物活性的丧失。如:
溶解度降低、黏度增加、结晶能力消失、生物活性的丧失、易被蛋白酶水解等。
第2章 核酸的结构与功能
一、核酸的化学组成及其一级结构
1、基本组成单位:核苷酸(碱基、戊糖、磷酸)
2、连接方式:3’,5’-磷酸二酯键
3、方向:5 → 3¢
4、一级结构:指核苷酸的排列顺序
5、分类:核糖核酸(RNA)、脱氧核糖核酸(DNA)
二、DNA的空间结构与功能
1、二级结构:双螺旋结构
模型要点: 反向平行、右手螺旋;
脱氧核糖和磷酸在外侧碱基内侧;
碱基配对原则 A—T C—G
2、DNA的高级结构:超螺旋结构
原核生物DNA为环状超螺旋结构
真核生物DNA为高度有序和高度致密的结构
三、RNA的结构与功能
1、信使RNA( mRNA )
开始转录成hnRNA加工后为成熟的mRNA
结构特点:密码子:每3个碱基为一个密码子
帽子结构:7-甲基鸟苷三磷酸
多聚A尾:多个腺苷酸连接而成
mRNA依照自身的碱基顺序指导蛋白质氨基酸顺序的合成,即为蛋白质的生物合成提供模板。
2、转运RNA(tRNA)
功能:是蛋白质合成过程中氨基酸的载体,将氨基酸运输到mRNA相应的位置上
3、核糖体RNA(rRNA)
rRNA与不同的蛋白质结合组成了核糖体的大、小亚基。
功能:核蛋白体是蛋白质合成的场所
第3章 酶
一、酶的分子结构与功能
蛋白质部分:酶蛋白 决定反应的特异性
1.全酶
辅助因子 金属离子、小分子有机化合物 决定反应的种类与性质
(辅酶或辅基)
2.酶的活性中心:指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物。
二 酶的工作原理
1、酶促反应的特点 :高效性 特异性 可调节性
酶促反应的特异性:绝对特异性;相对特异性;立体异构特异性
2、酶的作用原理:降低活化能 诱导契合假说
三、酶促反应动力学
1、底物浓度对反应速率的影响
Km值等于酶促反应速率为最大反应速率(Vmax)一半时的底物浓度,单位是mol/L
Km是酶的特征性常数之一,只与酶的结构、底物和反应环境(如,温度、pH、离子强度)有关,与酶的浓度无关。
2、抑制剂对酶促反应速率的影响
1)不可逆性抑制主要以共价与酶活性中心的必需基团相结合,使酶失活
2)可逆性抑制作用:抑制剂通常以非共价键与酶或酶-底物复合物可逆性结合,使酶的活性降低或丧失;
三种可逆性抑制剂作用的特点的比较
(1)竞争性抑制剂:抑制剂结构与底物结构相似,共同竞争酶活性中心。抑制作用大小与抑制剂和底物的相对浓度有关。Km升高,Vm不变。
(2)非竞争性抑制剂:抑制剂结构与底物结构不相似或完全不同。它只与活性中心以外的必需基团结合,使E和ES都下降。该抑制作用的强弱只与抑制剂的浓度有关。Km不变,Vm下降。
(3)反竞争性抑制剂:抑制剂并不与酶直接结合,而是与ES复合物结合成ESI,使酶失去催化活性。结合的ESI则不能分解成产物,Km下降,Vm下降。
磺胺类药物的抑菌机制——与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶
(1)细菌在生长繁殖
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