2010AB_第十七章课件.ppt

生物技术将是未来经济发展的新动力 第一次技术革命 工业革命 解放人的双手 第二次技术革命 信息技术 扩展人的大脑 第三次技术革命 生物技术 改造生命本身 4.通过冷冻精液的传递，能使参加后裔测定的公畜与来自不同地区、不同群体的母畜交配，从而获得数量更多、分布范围更广泛的生产性能测定数据，使得对公畜的遗传评定更精确 5.采用精液长期冷冻保存技术，还可以更经济可靠地实现家畜品种资源保护 遗传连锁图谱(genetic map) 遗传连锁图谱是利用多态性遗传标记进行遗传连锁分析得到的反应遗传标记间相对关系的图谱。 建立遗传连锁图谱的理论基础是染色体的交换和重组, 即通过计算连锁的遗传标记间的重组频率, 确定它们的相对距离, 一般用厘摩(centiMorgan, cM )表示, 1 厘摩即每次减数分裂的重组频率为1%。 遗传连锁图谱(genetic map) 三、标记辅助选择(MAS) What is a GWAS? Illumina BeadArray 50万个不同的磁珠 不同排列类型的Illumina芯片 磁珠随机分布在芯片上 每个磁珠附有大量探针（Taq ＋ Reporter） 探针与基因组DNA结合 双脱氧核苷酸与特定SNP连接 SNP分型 基因组系谱 SNP 系谱 atagatcgatcg ctgtagcttagg agggcgcgcagt cgatctagatcg cggtagatcagt agagatcgatct atggcgcgaacg ctatcgctcagg ctgtagcgatcg agatctagatcg agagatcgcagt atgtcgctcacg ctgtctagatcg atgtcgcgcagt 基因型系谱 121101011110 111211120200 101121101111 122221121111 101101111102 011111012011 121120011010 0 = homozygous for first allele (alphabetically) 1 = heterozygous 2 = homozygous for second allele (alphabetically) 生产性状表型值 基因型（50K） 基因型（50K） 建立模型，通过基因型预测个体育种值 预测个体育种值进行选种 The End 数量性状基因座定位 数量性状基因座位（quantitative trait locus, QTL）: 在基因组中占据一定染色体区域，控制同一性状的一组微效多基因的基因簇。 一般认为，QTL是指影响数量性状变异的染色体区段，而不是一个确定的基因座（locus），通常该区段包含了数十到数百个不等的基因座。 在控制一个性状的所有QTL中，通常都存在一个或数个效应较大的QTL，它们能单独解释表型总变异的10~50%甚至更多，当其中一个位置明确的基因座效应达到一定阈值时，即可将该位置处的基因称为主基因（major gene）。 数量性状位点定位(QTL作图) 通过连锁分析确定出QTL在图谱上的位置与特定连锁标记之间的遗传距离, 进而确定QTL的表型效应。 QTL 定位的策略: 利用QTL 与遗传标记之间的连锁关系, 在一个大群体中进行标记基因型和被测数量性状表型值记录, 通过统计方法进行连锁分析, 确定连锁关系。 标记-QTL连锁分析的基本步骤 进行试验设计 2.收集数据 3. 构建标记连锁图谱 4. QTL的检测与参数估计 试验设计 （1）基于近交系或品系杂交的试验设计 回交（Back Cross）设计：用杂交所得的F1个体与两个亲本中的一个回交，利用回交后代的标记基因型信息和数量性状的表型信息进行标记-QTL的连锁分析 F2设计：是将F1个体互交产生F2代个体，利用F2代个体的标记基因型信息和数量性状的表型信息进行标记-QTL的连锁分析 F2 intercross: Informative pig pedigree X QQ qq QQ Qq qq q q q q q q q q q X X X Large White Large White Meishan Meishan F1 F2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 q 1 2 （2）基于分离群体的试验设计 半同胞家系 全同胞家系 混合家系 三代家系资料及DNA F2代性状测定数据 QTL检测 Unobserved QTL alleles q m Q M Observed marker alleles pair of