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Ch.1 蛋白质的结构与功能 Part 1 名词解释 Peptides 肽 最小的蛋白质是胰岛素和某些蛇毒蛋白，相对分子量大约6000，小于该下线者叫做肽（Peptides），蛋白质通常称为多肽。 Simple proteins 简单蛋白质 Conjugated proteins 缀合蛋白质 按照组分是否单一，蛋白质分为简单蛋白质和缀合蛋白质两大类。简单蛋白质分子仅仅由20种普通氨基酸组成，而缀合蛋白质除了蛋白组分外，还有非蛋白组分——辅助因子，包括辅基，辅酶和金属离子。 Coenzyme 辅酶 作为酶的辅因子的有机分子，本身无催化作用，但一般在酶促反应中有传递电子、原子或某些功能基团(如参与氧化还原或运载酰基的基团)的作用。它通过非共价键与多肽链链接，在大多数情况下，可通过透析或者超滤将辅酶除去。 Prosthetic group 辅基 酶的辅因子或结合蛋白质的非蛋白部分（其中较小的非蛋白质部分称辅基），通过共价键与多肽链链接，与酶或蛋白质结合的非常紧密，不易与多肽链分离，用透析法不能除去。 Configuration 构型 在立体化学中，因分子中存在不对称中心而产生的异构体中的原子或取代基团的空间排列关系。有D型和L型两种。构型的改变要有共价键的断裂和重新组成，从而导致光学活性的变化。 这种有机分子空间的排列方式具备以下两种特征：1具有不能自由旋转的双键2.具有手型中心 Conformation 构象 指单键自由旋转使有机分子组成基团在空间的排列位置具有随意性，而改变这些位置（构象）不需要共价键发生断裂。 Chiralcarbon 手性碳原子 直接和四个不相同的原子或原子团相连的碳原子叫做“手性碳原子”（chiralcarbon atoms） 或“不对称碳原子”（asymmetric carbon atoms） Enantiomers 对映异构体 互为物体与镜像关系的立体异构体,称为对映异构体 (enantiomers,简称为对映体). 对映异构体都有旋光性,其中一个是左旋的,一个是右旋的. 所以对映异构体又称为旋光异构体.　简单的说也就是两个异构体之间的关系就如同一个物体的立体结构在照镜子，这个立体结构和它在镜子中的像互为对映异构体。 Optical isomers 光学异构体 具有相同的熔点，溶解度等物理性质和相同的化学性质但旋光方向相反的两种L-和D-构型的异构体成为光学异构体。 cis and trans isomers 顺反异构：立体异构的一种，由于双键不能自由旋转引起的，一般指烯烃的双键，也有C=N双键，N=N双键及环状等化合物的顺反异构。 顺式异构体：两个相同原子或基团在双键同一侧的为顺式异构体，也用 cis- 来表示。 反式异构体：两个相同原子或基团分别在双键两侧的为反式异构体，也用 trans- 来表示。 顺反异构体产生的条件：⑴ 分子不能自由旋转（否则将变成另外一种分子）；⑵ 双键上同一碳上不能有相同的基团； Ampholytes 两性电解质 同时带有可解离为负电荷和正电荷基团的电解质。如氨基酸.它在大于其等电点的pH环境中解离成带负电荷的阴离子，向电场的正极泳动，在小于其等电点的pH环境中解离成带正由荷的阳离子，向电场的负极泳动。 isoelectric point 等电点 蛋白质或两性电解质(如氨基酸)所带净电荷为零时溶液的pH，此时蛋白质或两性电解质在电场中的迁移率为零。符号为pI。若为多元酸，PI为其净电荷为零时左右PK的平均值。 Peptide plane 肽平面 在肽键中，由于酰胺N原子和羰基之间发生电子离域作用形成共振杂化体结构，以至C-N之间具有部分双键的性质不再是典型的单键，因此不能自由旋转;而羰基碳氧之间具有部分单键的性质，也不再是典型的双键。于是形成肽键的四个原子与其左右相邻的两个C原子处于同一个平面，这两个C原子反式排列，该平面叫肽平面。 Dihedral angle 二面角（书P7） 多肽链可以看作是一个个肽平面通过C原子链接而成，N-C和C-C均以单键相连，可以自由旋转，相邻的两个肽平面没必要在同一个平面。N-C之间和C-C之间旋转的角度叫做二面角。 Ramachandran 拉氏构象图　根据蛋白质中非键合原子间的最小接触距离，确定了哪些成对二面角（Φ、Ψ）所规定的两个相邻肽单位的αγ构象是允许的，哪些是不允许的，并且以Φ为横坐标，以Ψ为纵坐标，在坐标图上标出，该坐标图称拉氏构象图（The Ramachandran Diagram）。可用来鉴定蛋白质构象是否合理。 Primary structure of proteins 蛋白质的一级结构 指多肽中从N-端到C-端的氨基酸排列顺序,包括二硫键的位置 Seco