12酶催化反应机制..pptVIP

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第八章 酶催化反应机制 第一节 前言 一 两个专一性假说: 1 锁钥(lock and key)结合假说: 由Fisher早期(1894)提出的理论 整个酶分子的构象是完整无缺的(刚性),酶和底物之间是紧密配合的。 2 诱导契合学说(induced-fit hypothesis): 1958年,Koshland 提出。提出酶活性中心的可变性(挠性)。底物和酶结合时由于诱导和契合使酶活性中心变化和底物紧密结合。 二 酶与底物相互作用——过渡态 E + S ES* E+P 酶通过与底物形成过渡态中间物, 降低反应活化能而加速反应。 过渡态中间物的维持力主要是一 些次级键:氢键、离子键、疏水力等, 形成过程中放出大量能量,抵消了部分活化能 处于过渡态的酶与底物的具有很高的亲和力,比底物或产物高出几个数量级 底物过渡态类似物: 例如天然具有半椅式结构的环内酯作为溶菌酶的底物,对酶的亲和力比一般糖环高3600倍。 (二) 底物形变与诱导楔合 底物形变(distortion)和诱导契合(induced fit): 酶与底物在构象上相互诱导以便更好配合,作用力的产生往往导致底物形变,使被作用的底物敏感键极易断裂 例如:溶菌酶催化时使底物糖环由椅式转变为半椅式 (三) 广义酸碱催化及共催化: 广义酸碱催化:质子供体或受体的催化 例如:葡萄糖变旋反应: 广义碱催化: 广义酸催化: 共催化(多元催化):是酸和碱的共同参与催化的机制 电荷中继网(charge relay network)或质子转移通路: H-O O- …… H-N N …… H-O O …… H+ C P O- O- 羧基 咪唑基 磷酸基 电子云由左向右移动,质子由右向左传递 质子转移通路上的各个基团都是广义酸,同时又是广义碱 (四) 共价催化: 标志:催化过程中形成共价中间物 1 亲核催化: 带有多余电子对的基团或原子攻击缺少电子而带有部分正电性的原子或基团并形成不稳定的共价中间物的催化方式。 亲核试剂: Glu-COO- Asp-COO- His-咪唑基 2 亲电催化: 由缺少电子的亲电试剂从带负电的基团上夺取一对电子并形成共价中间物的催化方式。 亲电试剂: -NH3+ (五) 微环境催化: ① 酶活性中心提供一个低介电区: 低介电环境有利于电荷间相互作用,而极性环境往往对电荷有屏蔽作用。 ② 局部环境差异使催化基团的解离状态不一样, 例如: 溶菌酶的两个催化羧基: Glu35-COOH Asp52-COO- (六) 作为辅助因子的金属离子的催化 金属酶类:酶和金属结合牢固 被金属激活酶类:在分离纯化过程中不带金属, 人为加入来激活酶类 金属离子的功能: 1. 维持酶的活性构象,使酶处于催化有利状态 2. 对底物有定位作用,如: Metal 丙酮酸激酶 ATP 丙酮酸 3. 作为超酸催化剂参与催化 : 金属离子所带电荷可以不止一个;并且

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