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第一章、基因和基因组 题目一：病毒基因组、细菌基因组、真核生物基因组特点；原核生物和真核生物基因组的异同点；DNA序列类型。 一、病毒基因组特点 ： 病毒是最简单的原核生物，完整的病毒颗粒包括外壳蛋白和内部的基因组DNA或RNA 1、遗传物质： (1)病毒基因组可以由DNA组成，也可以由RNA组成; (2)组成病毒基因组的DNA和RNA可以是单链的，也可以是双链的; （3）可以是闭环分子，也可以是线性分子; （4）大多数DNA病毒的基因组是双链DNA分子，而大多数RNA病毒的基因组是单链RNA分子。 2、基因组大小： 毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比，病毒的基因组很小，DNA只有3kb大小 。 3、含有重叠基因 重叠基因即同一段DNA片段能够编码两种甚至三种蛋白质分子 。4、病毒基因组的大部分是用来编码蛋白质的，只有非常小的一份不被翻译 。 5、转录产物为多顺反子。 6、噬菌体（细菌病毒）的基因是连续的；而真核细胞病毒的基因是不连续的， 具有内含子。 7、除了逆转录病毒以外，一切病毒基因组都是单倍体，每个基因在病毒颗粒中只出现一次逆转录病毒基因组有两个拷贝。 二、细菌染色体基因组结构的一般特点： 1、遗传物质：通常仅由一条环状双链DNA分子组成。染色体DNA通常与细胞膜相连，连接点的数量随细菌生长状况和不同的生活周期而异。 2、基因组大小：基因组小，但比病毒的大。 3、细菌基因组中编码顺序一般不会重叠，即不会出现基因重叠现象。 4、细菌基因组中结构基因序列连续不断的排列，没有内含子，因此转录后不需要剪切加工。 5、DNA绝大部分是编码蛋白质的 。6、结构基因在细菌染色体基因组中都是单拷贝，但是编码rRNA的基因rDNA往往是多拷贝的。 7、有操纵子结构： 操纵子的结构基因为多顺反子，即数个功能相关的结构基因串联在一起，受同一个调节区的调节。数个操纵子还可以由一个共同的调节基因即调节子所调控.。 三、真核生物基因组的一般特点： 1、真核生物的基因组一般比较庞大，远远大于原核生物的基因组。不编码蛋白质的DNA序列多于编码区。 2、真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内。体细胞内的基因的基因组是双份的（即双倍体），即有两份同源的基因组。 3、真核细胞基因转录产物为单顺反子。一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRNA分子和一条多肽链。 4、存在重复序列，重复次数可达百万次以上。 5、基因组中不编码的区域多于编码区域。 6、大部分基因含有内含子，因此，基因是不连续的。称为断裂基因。 四、真核生物DNA序列的类型 1、单一序列 也称单拷贝序列、拷贝顺序。。 根据DNA序列重复的次数不同分为高度重复序列和中度重复序列 （1）高度重复序列 重复频率高，可达百万(106)以上，复性速度很快。在人基因组中约占20％。 1）卫星DNA 序列短，一般由2～200bp组成，成串排列。属于串联重复序列 重复106次以上 。在人细胞组中卫星DNA约占5-6％。 典型卫星DNA序列为5～10bp。 ①大卫星DNA：主要分布与人染色体的着丝粒和异染色质区。按照它们的浮力密度不同，可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和α、β。 ②小卫星DNA：重复顺序为6～70bp的称为小卫星DNA（minisatellite DNA），在基因组的间隔序列和内含子等非编码区内； ③微卫星DNA：1～6bp的短小重复单位，称为微卫星DNA（microsatellite DNA）如GACA、GATA、TCC、CT、CA等。在基因组中分布广泛而表现出多态性 。 ④端粒 ：端粒是染色体的物理末端，由端粒酶加上去的，也是重复序列。 人的端粒是由串联的TTAGGG重复序列组成，对染色体起保护作用，防止染色体从排、断裂等，端粒长则细胞寿命长 。 2） 反向重复序列 约占人基因组的5％，单独或与其它重复序列散在分布于基因组中。每个基因的终止子前方都有一个反向重复序列。 3）高度重复顺序的功能 ［1］参与复制水平的调节 ［2］参与基因表达的调控 ［3］转位作用 ［4］同一种属中不同个体的高度重复顺序的重复次数不一样，这可以作为每一个体的特征，DNA指纹图谱。 ［5］维持着丝粒的强度 ［6］参与某些基因重组 ［7］同源染色体之间的联会可能依赖于具有染色体专一性的特定卫星DNA顺序。 （2）中度重复顺序 中度重复序列指在真核基因组中重复数十至数万（105）次的重复顺序。其复性速度快于单拷贝顺序，但慢于高度重复顺序。 大多数与单拷贝基因间隔排列。 依据重复顺序的长度，中度重复顺序可分为两种类型。 1）短分散片段 平均长度约为300bp（500bp） 拷贝数可达10万左右 与平均长度约为1000bp的单拷贝顺序间隔排列。 2）长分散片段