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第二章 核酸的结构与功能 Structures and Functions of Nucleic Acids 2.1.1 概 述 核酸:一种生物大分子;是活细胞中最关键的组分,它携带着遗传信息,是遗传的物质基础;决定蛋白质和酶的结构,决定每一种生物体的代谢类型和形态。 核酸的发现: 1868年 F. Miescher从脓细胞中提取“核素” ,鲑精头部分离出“DNA”; 20年后 R. Altmann分离到不含蛋白质的核酸,提出“核酸”这一名词 ; 1910年A. Kossel及其同事:鉴定核酸中的碱基(诺贝尔奖); 1912年Levene: 鉴定核酸中的糖及阐明核苷酸的化学键,但其“四核苷酸”假说阻碍核酸研究达30年之久; 1944年 Avery等人证实DNA是遗传物质; 1953年 Watson和Crick发现DNA的双螺旋结构; 1966年 Nirenberg等发现遗传密码。 2.1.2 核酸的种类 2.1.3 核酸的分布 几乎所有的生物体(包括细菌、病毒)内都含有核酸。大多数生物既含有DNA又含有RNA,在病毒分子中,只含有一种核酸(DNA或RNA)。 2.2.1 核酸的基本组成 基本元素:C、H、O、N、P (9~10%) 基本单位:核苷酸 核酸的酸解过程: 2.2.2 碱基 2.2.3 戊糖 2.2.4 核苷 碱基和核糖(或脱氧核糖)通过C-N 糖苷键连接形成核苷(或脱氧核苷)。 2.2.5 核苷酸 核苷(脱氧核苷)和磷酸以酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸)。 2.核苷多磷酸 核苷多磷酸的生物学功能: §NTP和dNTP分别是RNA和DNA的直接前体。 §ATP分子的最显著特点是含有两个高能磷酸键。水解时, ATP可以释放出大量自由能,推动生物体内各种需能的生化反应。 §UDP、ADP、GDP在多糖合成中,可作为携带葡萄糖基的载体;CDP在磷脂合成中可作为携带胆碱的载体。 §GTP、CTP、UTP在某些生化反应中也具有传递能量的作用。 环核苷酸的生物学功能: DNA的一级结构测序 Sanger双脱氧链终止法 在PCR时分别加入ddA, ddT, ddC, ddG(相应于4种碱基) ddX的两个作用: 可以当作正常碱基参与复制 一旦链入DNA中,其后就不能再继续连接 电泳 谁终止,碱基就是谁 此方法获1980年Nobel化学奖 现有的自动化测序仪基本按此原理设计 制备单链模板 将单链模板与一小段引物退火 加入DNA聚合酶(Klenow)+ 4种dNTP + 引物 (分别加入少量4种ddNTP) 将4种反应产物分别在4条泳道电泳 根据4个碱基在4条泳道的终止位置读出基因序列 2.3.2 DNA的二级结构 双螺旋模型的主要依据 双螺旋模型的要点 双螺旋模型的稳定因素 双螺旋结构的多样性 三链DNA DNA的结构,发表于《自然》171卷(1953) 737-738页上的插图 DNA双螺旋结构发现的故事 James Watson (生物) Francis? Crick (物理) Maurice Wilkins (物理) Rosalind Franklin (化学) Linus??Pauling (生物化学):美国加州理工大学 右手性的定义示意图。大姆指指向轴向,其他四指由掌根向指尖方向表示螺旋转动方向。 配对碱基的氢键 (三)双螺旋结构的稳定因素 1. 碱基堆积力 2. 配对碱基形成的氢键 3. 离子键 碱基堆积力是最主要的稳定因素。 互补碱基之间的氢键: G-C间有3个氢键,A-T之间仅有2个氢键, 故前者较稳定。 离子键: 带负电荷磷酸之间的静电斥力——会造成不稳定,但带负电荷磷酸可与阳离子结合有助于结构的稳定。 Na+、K+、Mg2+、Mn2+ 是真核细胞内的组蛋白之间形成的离子键,中和了负电荷,降低了DNA链本身不同部位之间的斥力。 DNA双螺旋结构提出的生物学意义 该模型揭示了DNA作为遗传物质的稳定性特征,最有价值的是确认了碱基配对原则,这是DNA复制、转录和反转录的分子基础,亦是遗传信息传递和表达的分子基础。该模型的提出是20世纪生命科学的重大突破之一,它奠定了生物化学和分子生物学乃至整个生命科学飞速发展的基石。 如果人体有1014个细胞,每个体细胞的DNA量为6.4×109对核苷酸。试计算人体DNA的总长度是多少?这个长度与太阳-地球之间的距离(1.5×108 km)相比如何? ①每个体细胞内DNA的总长度:6.4×109×0.34=2.176×109nm ②人体DNA的总长度:2.176×109×1014=2.176×1023nm=2.176
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