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新非编码rna及其基因的系统现和“双色网络”构建2009cb825400-g新非编码rna及其基因的系统发现和“双色网络”构建2009cb825400-g
项目名称: 新非编码RNA及其基因的系统发现和“双色网络”构建 陈润生 中国科学院生物物理研究所 2009.1至2013.8 中国科学院
二、预期目标
总体目标是:系统地发现非编码RNA及其基因;确定非编码RNA与各种生物大分子(DNA、RNA及蛋白质等)的相互作用;构建由RNA和蛋白质共同实现的典型pathway或生物网络(双色网络);分析这类网络的数学、物理学特征;推断它们的生物学含义及可能的新规律。
五年预期目标是:
1、应用已有的和自己发展的RNA组学、tiling array、生物信息学等技术,在人、恒河猴、小鼠及线虫中系统地发现新的非编码RNA,其总数量不少于一千个, 并发现新的非编码RNA家族。
2、鉴定出一些在中枢神经系统形成和神经导向方面起关键调控作用的、在DNA损伤修复过程以及在骨骼肌发育中起重要调控作用的非编码RNA,并寻找与这些非编码RNA相互作用的靶分子。
3、基于上述实验结果在神经导向、DNA损伤修复或骨骼肌发育相关的pathway中至少构建出一种由非编码RNA和蛋白质共同构成的双色网络。建立该网络的数学模型,分析模型的数学、物理学特征,推断其生物学含义,以期发现新规律。
4、建立至少两种检测非编码RNA与其他生物大分子相互作用的方法;完善非编码RNA数据库--NONCODE和非编码RNA与其它生物分子相互作用数据
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