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不同毒性条锈菌生理小种分泌蛋白基因变异分析.
xxxxx大学
本科生毕业论文(设计)
题 目: 不同毒性条锈菌生理小种分泌蛋白基因变异分析
学 院: 生命科学学院
专业班级: 级生物技术班
学生姓名:
指导教师: 教授
撰写日期: 201 年 月 日
生命科学学院
摘 要:小麦锈病是世界性小麦病害,在全球大多数小麦产区均有发生,严重威胁小麦粮食安全。小麦条锈病是由条形柄锈菌(Puccinia striiformis f. sp. tritici,Pst)引起的叶部病害,属担子菌亚门柄锈菌属。通过对CY32(China)CY23 (China) 、PK-CDRD(Pakistan)、Pst-78 (US)菌种的扩繁,收集到了足量的锈然后对其用CTAB\SDS法提取条绣菌基因组DNA;通过对重测序结果分析,筛选一个候选分泌蛋白基因striiformis_Gene7472进行测序验证,发现这个基因在四个生理小种之间存在单核苷酸多态性(SNP) 、小片段插入缺失(InDel)变异
关键词: 小麦锈病单核苷酸多态性
variation analysis of different isolates secretory protein gene
HE Sheng
(College of Life Sciences)
Abstract:Wheat stripe rust is a worldwide wheat disease, occurring in most of the wheat producing regions, threatening the safety of wheat grain production.Wheat stripe rust (Puccinia striiformis f. sp. tritici. Pst) caused by leaf disease, belongs to basidiomycotina Puccinia.We inoculate CY32 (China), CY23 (China), PK-CDRD (Pakistan), Pst-78 (US) on the wheat cultivars MX169, collected plenty of stripe rust;Then we extract the genomic DNA by using the method of CTAB\SDS, and selected a candidate secretory protein gene striiformis_Gene7472 by collating and organizing the re-sequencing results.Finally we identify the results and found that the gene between the four isolates exist single nucleotide polymorphisms (SNP) , a small fragment insertion deletion (InDel) variation.
Key words : Wheat stripe rust;SNP;InDel
引言
小麦锈病是世界性小麦病害,包括条锈病、叶锈病与秆锈病,在全球大多数小麦产区均有发生,严重威胁小麦粮食安全生产。同时,锈菌可借助气流实现高空远距离传播,导致病害在各个小麦产区间流行,是影响粮食安全的重大生物灾害。小麦锈病曾频繁造成包括我国在内的全球小麦主产国毁灭性的产量损失。仅建国后,条锈病在我国就发生了9次大流行,对小麦生产造成了灾难性的影响。特别是1950、1964、1990和2002年的四次大流行分别使小麦减产60亿kg、32亿kg、25亿kg和10亿kg。进入本世纪以来,由于小麦条锈菌毒性变异和新小种产生,小麦条锈病已在我国小麦产区连续流行了近10年,年损失小麦在10亿公斤左右。
近年来,小麦锈病在全球的发生和流行引起各国科学家的高度关注,世界各国非常重视小麦锈病研究工作。在诺
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