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Autism 孤独症谱系--智力落后 1.8 AUTS8 位于3号染色体的长臂(3@5一q27)区域。Auranen等(2002)在对38个芬兰孤独症家系的研究中发现1/3先证者的直系亲属有艾斯伯格综合征或进行性吞咽困难。在对其中19个只有孤独症患者的家系的研究中发现了3q25一q27与孤独症的连锁。在D3S3037处得到的最大两点LOD值为3.16，另外包含艾斯伯格综合征的l8个家系的I 0D值为4.3l。 　　l.9 AUTS9 位于7号染色体的长臂(7q31)区域。国际孤独症分子遗传学研究协会(1998)对87个患病同胞对和12个非患病同胞对共99个家系进行了研究，在6条染色体同时得到了多个最大L0D值 1的区域，其中7q3l一(t34最为明显。只用其中的87个患病同胞对进行分析时，在D7S53O和D7S684区域得到最大I OD值为2.53 。Lamb等(2005)在对219个受累同胞对的研究中发现了7q上的两个连锁位点，分别为D7S477和D7$530与D7S640之间的区域。D7$530多点连锁分析最大I.OD值为2.31;又增加了145个男性同胞对后，L0D值在D7S480与D7S530区域增至2.55。这提示基因印记在孤独症的发生中有重要作用 。Trikalinos等(2006)对9项孤独症或孤独症谱系疾病基因组扫描研究做了荟萃分析，得出7q22一q32与孤独症有明显连锁。 　　1.10 AUTS1l 位于l号染色体的长臂(1q24)区域。Buxhaum 等(2004)对62个至少有两名孤独症或孤独症谱系疾病患者的家系进行了研究，家系的选择依据患者是否有强迫观念与行为。研究发现1q24.2与孤独症有连锁，在D1S1 65l处的多点I OI)值为3.O6，两点非参数LOI)值为3.21.连锁位点位于I)1$547与D1$346之间 。Barlett等(2005)用后验概率连锁(posterior probability linkage PPI )也得出l(t23一q24区域与孤独症有明显连锁 。 　　 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. FISH skew : High False Positives And Negatives歪曲了周围区的缺失—分辨率粗糙 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. HER2 False Positive by FISH Centromere deleted Relative to centromere Her2 is “gained” Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. Her2 False Negative Chr 17 amplified Her2 relative to centromere “not gained” Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 二代测序与全基因组芯片比较 NGS相关产品 Cytoscan 备注 精确度 精确度与测序深度有关，目前的成本不到1个reads的coverage很难保证结果的精确性 50kb。有多篇文献甚至报道发现的CNV小于50kb。FDA的认证也认可这样的分辨率 测序深度对于数据的可靠性非常重要，目前的NGS都未很明确的标注深度，对其CNV检出能力值得怀疑 基因组覆盖度 由于Coverage的偏差，每次run的结果可能都不一致 CNV+SNP设计，全基因组覆盖 稳定性 科诺安仅做了85例的与SNP芯片对比试验，得出的重复性结果值得怀疑 FDA认可Cytoscan作为遗传病的检测手段，证明其稳定性高 技术原理 测序有于在构建测序文库的过程中有PCR放大的过程，因此相对灵敏度较高（需要高覆盖倍数的测序深度配合），但也由于PCR放大过程的不均衡性，样品中片段的内在浓度比例常常会被破坏掉。造成结果的假阳性等 由于是核酸杂交，不需要扩增，是封闭的系统，保真性高 数据库参考 目前没有统一的libarary